Les récentes pandémies de H1N1pdm en 2009 et de Sars-CoV-2 en 2020 offrent un aperçu très négatif des virus. Cependant, l'avènement des nouvelles technologies de séquençage à haut débit a considérablement accru notre connaissance de ces entités biologiques, révélant que le corps humain en bonne santé est habité par au moins dix fois plus de virus que de cellules le constituant. Il est donc nécessaire de réévaluer le rôle des virus dans l'équilibre physiologique de l'organisme humain, étant donné qu'ils sont omniprésents. Le virome, c'est-à-dire l'ensemble des virus présents dans un corps humain, est d'une grande diversité. Il est composé de virus infectant nos cellules, pouvant ou non provoquer une infection aiguë symptomatique, ou rester dans l'organisme toute la vie sans signe clinique. Cependant, la majorité du virome humain est constituée de virus infectant les bactéries, formant ainsi le phageome. Par conséquent, le microbiome humain est lui-même sujet aux infections virales qui auront des répercussions sur la santé. Le virome, par ses interactions avec son hôte, joue de nombreux rôles au sein de l'organisme : il module l'abondance des différentes espèces bactériennes, il influence le système immunitaire et contribue au maintien de la santé ou à l'apparition de maladies.

The recent pandemics of H1 N1pdm in 2009 and Sars-CoV-2 in 2020 provide a very negative insight into viruses. However, the advent of new high-throughput sequencing technologies has significantly increased our understanding of these biological entities, revealing that the healthy human body is inhabited by at least ten times more viruses than the cells constituting it. It is therefore necessary to reassess the role of viruses in the physiological balance of the human body, given their omnipresence. The virome, which encompasses all viruses present in a human body, is highly diverse. It consists of viruses infecting our cells, which may or may not cause acute symptomatic infections, or remain in the body for life without clinical signs. However, the majority of the human virome is composed of viruses infecting bacteria, thus forming the phageome. Consequently, the human microbiome itself is subject to viral infections that will have an impact on health. The virome, through its interactions with its host, plays numerous roles within the body: it modulates the abundance of different bacterial species, influences the immune system, and contributes to maintaining health or the onset of diseases.