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Caractérisation moléculaire et biodiversité de Mycobacterium tuberculosis dans la région Antilles-Guyane et analyse comparative à une région métropolitaine, l'Aquitaine - 01/01/03

Doi : 10.1016/S0369-8114(03)00048-8 

K.  Brudey a ,  I.  Filliol a ,  C.  Sola a ,  C.  Bébéar b ,  S.  Elia-Pasquet c ,  J.  Texier-Maugein b ,  N.  Rastogi a * *Auteur correspondant.

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Résumé

La tuberculose est une maladie infectieuse et contagieuse en pleine recrudescence et dont la surveillance épidémiologique a été renforcée par des techniques de biologie moléculaire. Dans ce contexte, nous nous sommes particulièrement intéressés aux cas de tuberculose de la région Antilles-Guyane sur une période de deux ans (1997 et 1998) par l'analyse de leurs génotypes. Nos résultats ont été confrontés à une région métropolitaine (l'Aquitaine) équivalente démographiquement avec des liens privilégiés vis-à-vis de notre région et bénéficiant d'un réseau de surveillance pour la tuberculose comparable au nôtre. Ainsi, nous avons employé la méthode PCR appelée spoligotypage, utilisée en première intention afin d'optimiser la méthode IS6110-RFLP appliquée depuis plusieurs années mais demeurant contraignante. Ainsi 105 souches des Antilles-Guyane et 172 souches d'Aquitaine ont été typées par spoligotypage et par la méthode de référence IS6110-RFLP. Les résultats du premier groupage par spoligotypage ont fait l'objet d'une analyse comparative par les empreintes génomiques obtenues par IS6110-RFLP. Ainsi le taux de transmission récente a été estimé à 34,3 % dans la région Antilles-Guyane et à 10,5 % en Aquitaine lui conférant un degré de polymorphisme important. Grâce au différents profils obtenus par spoligotypage, nous avons pu étudier leur répartition dans les trois différentes régions et mettre en évidence des types qui leurs sont communs comme les types 53, 50 et 42, des types plus localisés comme les types 33 et 14 retrouvés respectivement en Aquitaine et aux Antilles ainsi que des types endémiques comme le 76 retrouvé uniquement en Guyane. De ce fait, nous avons pu émettre des hypothèses quant à l'évolution des souches au cours du temps.

Mots clés  : Mycobacterium tuberculosis ; génotypage ; biodiversité ; Antilles-Guyane ; Aquitaine.

Abstract

Tuberculosis is a highly contagious infectious disease in recrudescence whose epidemiologic monitoring is reinforced by molecular biology. In this context, we were particularly interested in the cases of tuberculosis of French West Indies and French Guiana (FWI-FG). This study covered a period of two years (1997 and 1998) and focused on the demographical and epidemiological characteristics of the cases diagnosed by an analysis of their genotypes. Our results were confronted with a French metropolitan area (Aquitaine) with similar demographic background. Moreover, Aquitaine area has privileged links with FWI-FG region and also has a similar network for monitoring tuberculosis as ours. So we used a PCR method called spoligotyping as a first line method to optimize the alternative IS6110-RFLP method which remains cumbersome. A total of 105 strains of FWI-FG and 172 strains of Aquitaine were typed by spoligotyping and by the standard IS6110-RFLP method. The results of the first grouping by spoligotyping were analyzed in comparaison with IS6110-RFLP. The results obtained showed a rate of recent transmission of tuberculosis being 34,3% in FWI-FG and 10,5% in Aquitaine. These observations underlined a high degree of polymorphism in the Aquitaine region as compared to the FWI-FG region. Thanks to the various profiles obtained by spoligotyping, we could study their distribution in the three areas and highlight common types like type 53, 50 and 42 and types found locally like the types 33 and 14 found respectively in Aquitaine and FWI as well as endemic types like type 76 found only in FG. These results are discussed in the context of the evolution of clinical isolates of tubercle bacilli with time.

Mots clés  : Mycobacterium tuberculosis ; fingerprinting ; biodiversity ; French West-Indies ; French Guiana ; Aquitaine.

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Vol 51 - N° 5

P. 282-289 - juillet 2003 Retour au numéro
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