L'evoluzione e la prognosi dei pazienti affetti da sclerosi multipla sono difficili da prevedere su scala individuale. A livello di gruppo, sono fortemente condizionate dal tipo di forma progressiva della patologia, con le attuali terapie che risultano efficaci nel prevenire un'attività infiammatoria e quindi un peggioramento legato a tale attività infiammatoria, mentre sono poco efficaci nel prevenire un peggioramento indipendente dall'attività infiammatoria. Lo studio di coorti recenti che hanno beneficiato di trattamenti di base convalidati ha rivelato un miglioramento della prognosi rispetto alle coorti storiche non trattate. Le forme recidivanti-remittenti hanno un'evoluzione a breve termine dipendente essenzialmente dal verificarsi di riacutizzazioni e dai loro postumi, anche se sempre più lavori documentano anche allo stadio iniziale di queste forme progressive la possibilità di un peggioramento indipendente dall'attività infiammatoria della patologia. Il rischio a lungo termine è quello di un'evoluzione verso una forma secondariamente progressiva. Le forme primarie progressive hanno un'evoluzione più peggiorativa, dal momento che l'aggravamento è solo debolmente legato all'attività infiammatoria e quindi poco influenzato dagli attuali trattamenti di base della patologia. Indipendentemente dalla forma progressiva della patologia, sono stati identificati numerosi fattori prognostici clinici, biologici e radiologici. Alcuni sono disponibili fin dalla diagnosi della patologia, mentre altri vengono valutati durante il follow-up, in particolare la persistenza dell'attività infiammatoria della patologia nonostante un trattamento di fondo.