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Typage des Virus Respiratoire Syncytial dans les hôpitaux universitaires sur la période 2019-2023 - 29/05/24

Doi : 10.1016/j.mmifmc.2024.04.328 
C. Boschi 1, L. Lesage 1, M. Bedotto 1, I. Ounas 2, A. Morand 1, B. La Scola 1, P. Colson 1
1 AP-HM, Marseille, France 
2 Lycée Marie Currie, Marseille, France 

Résumé

Introduction

Le virus respiratoire syncytial (VRS) est la cause la plus fréquente des infections respiratoires aiguës chez l'enfant dans le monde. Il existe deux génotypes A et B qui peuvent co-circuler au cours d'une même épidémie. Peu d'études à ce jour se sont intéressées au changement de génotype pendant la période de la pandémie de COVID-19 qui a été associée à des changements considérables de l'épidémiologie des infections dont celles à VRS. Le génotypage de ce virus pourrait permettre de mieux comprendre l'évolution globale de son incidence. Nous avons eu pour objectif de compléter le diagnostic d'infection VRS par le génotypage A ou B.

Matériels et méthodes

Le génotypage du VRS a été réalisé à partir d'extraits ARN de prélèvements nasopharyngés adressés au laboratoire de microbiologie-virologie dans la prise en charge diagnostique et clinique de routine et retrouvés positifs pour le VRS pour la période octobre 2019-mars 2023. Nous avons utilisé des tests maisons de PCR en temps réel ciblant spécifiquement les types A ou B, sur automate Light Cycler (Roche).

Résultats

Un total de 151 extraits ARN VRS-positifs ont été testés. Nous avons obtenu 81 VRS de type A et 70 VRS de type B. La moyenne d'âge des patients infectés par les VRS-A et VRS-B était la même (1.1 ans). Les deux génotypes ont co-circulé sur la période de l'étude. Nous avons détecté 8 VRS-A et 4 VRS-B pour l'hiver 2019-2020, 28 VRS-A et 12 VRS-B de mars 2021 à septembre 2021 et 45 VRS-A et 54 VRS-B pour l'hiver 2022-2023.

Conclusion

Les VRS des deux types A et B ont co-circulé sur la période d' étude mais avec une prédominance d'abord du VRS-A puis du VRS-B. Ces données sont importantes puisque certaines études révèlent que les VRS-A seraient associés à une plus grande sévérité clinique (bronchiolite plus sévère, plus d'hospitalisation en réanimation). De plus, ces données historiques et la poursuite du typage VRS sont importants afin de permettre la surveillance et d'interpréter les prévalences relatives VRS-A/B dans le contexte de l'utilisation de l'anticorps monoclonal Nirsévimab depuis septembre 2023 en France, de mieux caractériser l'épidémiologie des infections à VRS, et de faciliter leur surveillance génomique par séquençage de nouvelle génération.

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