Le facteur V (FV) Leiden correspond à une mutation ponctuelle qui conduit au remplacement d'une arginine par une glutamine en position 534 (ancienne nomenclature 506) de la séquence protéique du gène F5. Cette mutation affecte l'un des principaux sites de clivage du FV par la protéine C activée (PCa) ; le FV muté est donc moins sensible à l'action de la PCa, dont l'action inhibitrice devient moins efficace. Le FV Leiden est la cause la plus fréquente de thrombophilie héréditaire dans la population caucasienne. Sa présence à l'état hétérozygote majore le risque de premier événement thrombotique avec un risque relatif (RR) de l'ordre de 3 à 5, alors que l'influence de ce variant est faible sur le risque de récidive (RR : 1,5). Sa présence à l'état homozygote augmente en revanche le risque de premier événement thrombotique avec un RR de l'ordre de 7 à 20. Le variant c.*97G>A (ancienne nomenclature G20210A) du gène F2 est situé en aval de la région codante (région 3' non traduite), dans une région fonctionnelle conditionnant la maturation des ARN messagers (ARNm). Ce variant entraîne une augmentation du taux de prothrombine formé par amélioration de l'efficacité du clivage et de la maturation des ARNm, permettant une augmentation du nombre d'ARNm matures dans le cytoplasme. Sa présence à l'état hétérozygote majore le risque de premier événement thrombotique avec un RR de l'ordre de 2 à 3, alors que l'influence de ce variant est faible sur le risque de récidive (RR : 1,5). Sa présence à l'état homozygote augmente également le risque de premier événement thrombotique avec un RR de l'ordre de 2 à 20. La recherche du FV Leiden et du variant c.*97G>A du gène F2 font partie du bilan de thrombophilie standard. Le diagnostic de confirmation repose sur de la biologie moléculaire d'emblée (acte de biologie médicale remboursé).