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OSA microarray reader instrumentation and its applications for registration of on-chip real-time reactions - 15/09/23

Instrumentation pour la lecture des micro-puces par balayage optique et applications pour le suivi des réactions en temps réel

Doi : 10.1016/j.rbmret.2007.11.013 
E.B. Khomyakova , E.V. Dreval, A.A. Papin, F.-P. Soussaline
Imstar, 60, rue Notre-Dame-des-Champs, 75006 Paris, France 

Corresponding author.

Abstract

New applications of microarray technology requires new approaches to microarray reader development. Miniaturization of the biochips, necessity of massive parallel microarray-based analysis of various biological samples as well as increasing application of different real-time on-chip reactions for research and diagnostics demand improvement of microarray reader instrumentation. We represent the optical scanning array (OSA) reader system, allowing fast capture of high-resolution multifluorescence images and equipped with thermocontrolled hybridization chamber which is required for registration of a wide range of on-chip real-time processes. We demonstrate the application of OSA microarray reader for optimisation of hybridization and washing conditions for microarray-based detection of Q493X mutation of CFTR gene. It was shown that detailed analysis of on-chip thermodynamic and kinetic behaviour of oligonucleotide/oligonucleotide and ssPCR/oligonucleotide duplexes is very helpful for optimisation of experimental procedure.

Le texte complet de cet article est disponible en PDF.

Résumé

Les nouvelles applications des technologies à micro-puces nécessitent de nouvelles approches de développement des lecteurs de ces dispositifs. La miniaturisation des biopuces, les besoins d’analyses d’échantillons biologiques différents basées sur des micro- chip massivement mis en parallèle aussi bien que l’augmentation de la diversité des réactions pour le diagnostic et la recherche impliquent une amélioration de l’instrumentation de lecture. Nous présentons ici le système de lecture par balayage optique « Optical Scanning Array » ou OSA qui permet une capture rapide d’images à haute résolution en multi-fluorescence, ce système est équipé d’une chambre d’hybridation thermo contrôlée nécessaire à l’enregistrement d’une large plage de procédés en temps réel sur composant

Le texte complet de cet article est disponible en PDF.

Keywords : High-resolution microarray reader, On-chip kinetic and melting curves, Temperature-controlled microarray hybridization chamber

Mots-clés : Lecteur de puces haute resolution, Courbes sur composant de cinétique et de fusion, Chambre thermo contrôlée d’hybridation des puces


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Vol 28 - N° 5-6

P. 230-234 - novembre 2007 Retour au numéro
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