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Principes et contributions de la mise en réseau moléculaire en toxicologie clinique et médico-légale - 11/08/23

Principles and contributions of molecular networking in clinical and forensic toxicology

Doi : 10.1016/j.toxac.2023.05.002 
Romain Pelletier a, b, , Brendan Le Daré a, c, Alexis Bourdais a, Isabelle Morel a, b, Thomas Gicquel a, b
a UMR_S 1241, Institut Numecan (nutrition, métabolismes et cancer) UMR_A 1341, INRAE, Inserm, université de Rennes, 35000 Rennes, France 
b Laboratoire de toxicologie biologique et médicolégale, centre hospitalier universitaire de Rennes, 35033 Rennes, France 
c Pharmacie à usage intérieur, centre hospitalier universitaire de Rennes, 35033 Rennes, France 

Auteur correspondant.

Résumé

La spectrométrie de masse haute résolution (HRMS) a constitué une grande avancée pour la toxicologie analytique, permettant l’acquisition d’un grand nombre de données avec une grande précision. Cependant, le retraitement bio-informatique de ces données est parfois limitant et verrouillé par le logiciel commercial du fournisseur. La construction d’un réseau moléculaire fait appel à des outils bio-informatiques permettant le retraitement des données de spectrométrie de masse à l’aide de logiciels en accès libre et de regrouper de manière visuelle les molécules structurellement proches au sein d’échantillons. À partir des données brutes acquises par HRMS, plusieurs outils permettent ainsi de filtrer, puis retraiter ces données enfin d’être lues sur un logiciel graphique. Au-delà de l’annotation facilitée de composés connus au sein d’un échantillon complexe, cette méthodologie permet également d’identifier de nouveaux métabolites de xénobiotiques, ouvrant de nombreuses perspectives en toxicologie clinique et médicolégale. Nous présentons ici la méthodologie à adopter pour la réalisation de réseaux moléculaires ainsi que son apport en toxicologie hospitalière.

Le texte complet de cet article est disponible en PDF.

Summary

High-resolution mass spectrometry (HRMS) has been a great advance for analytical toxicology, allowing the acquisition of massive data with high accuracy. However, the bioinformatic reprocessing of these data is sometimes limiting and locked by commercial software. The construction of a molecular network calls upon bioinformatics tools allowing the reprocessing of mass spectrometry data with open access software and the visual grouping of structurally closed molecules within samples. From the raw data acquired by HRMS, several tools allow to filter and reprocess these data to be read on a graphic software. Beyond the easy annotation of known compounds within a complex sample, this methodology also allows the identification of new metabolites of xenobiotics, opening many perspectives in clinical and forensic toxicology. We present here the methodology to adopt for the realization of molecular networks as well as its contribution in clinical toxicology.

Le texte complet de cet article est disponible en PDF.

Mots clés : Réseau moléculaire, LC–HRMS, Toxicologie, Métabolisme, NPS

Keywords : Molecular networking, LC–HRMS, Toxicology, Drug metabolism, NPS


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Vol 35 - N° 3

P. 225-234 - septembre 2023 Retour au numéro
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