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Viral, Bacterial, Metabolic, and Autoimmune Causes of Severe Acute Encephalopathy in Sub-Saharan Africa: A Multicenter Cohort Study - 05/07/23

Doi : 10.1016/j.jpeds.2023.02.007 
Arthur Edridge, MD, PhD 1, 2, , Ruth Namazzi, MD, PhD 3, Andrew Tebulo 4, Anan Mfizi, MD 5, Martin Deijs 2, Sylvie Koekkoek 2, Bob de Wever, PhD 2, Arie van der Ende, PhD 2, Jeanine Umiwana 5, Menno D. de Jong, MD, PhD 2, Judith Jans, PhD 6, Nanda Verhoeven-Duif, PhD 6, Maarten Titulaer, MD, PhD 7, Clara van Karnebeek, MD, PhD 8, Karl Seydel, MD, PhD 4, 9, Terrie Taylor, DO 4, 9, Brenda Asiimwe-Kateera, PhD 10, Lia van der Hoek, PhD 2, Jean-Claude Kabayiza, MD, PhD 5, Macpherson Mallewa, MD, PhD 4, Richard Idro, MD, PhD 3, Michael Boele van Hensbroek, MD, PhD 1, Job B.M. van Woensel, MD, PhD 1, 11
1 Amsterdam Centre for Global Child Health, Emma Children's Hospital, Amsterdam UMC, University of Amsterdam, Amsterdam, The Netherlands 
2 Department of Medical Microbiology & Infection Prevention, Amsterdam UMC, University of Amsterdam, Amsterdam, The Netherlands 
3 Department of Paediatrics, Makerere University, Kampala, Uganda 
4 Blantyre Malaria Project, Kamuzu University of Health Sciences, Blantyre, Malawi 
5 Department of Paediatrics, University Teaching Hospital of Kigali, Kigali, Rwanda 
6 Laboratory of Metabolic Diseases, UMC Utrecht, Utrecht, The Netherlands 
7 Department of Neurology, ErasmusMC, Rotterdam, The Netherlands 
8 Departments of Pediatrics and Human Genetics, Emma Center for Personalized Medicine, Amsterdam University Medical Centers, Amsterdam, The Netherlands 
9 Department of Osteopathic Medical Specialties, College of Osteopathic Medicine, Michigan State University, East Lansing, MI 
10 College of Medicine and Health Sciences, University of Rwanda, Kigali, Rwanda 
11 Paediatric Intensive Care Unit, Emma Children's Hospital, Amsterdam UMC, Amsterdam, The Netherlands 

Reprint requests: Arthur Edridge, MD, PhD, Amsterdam Centre for Global Child Health, Emma Children's Hospital, Amsterdam UMC, University of Amsterdam, Amsterdam, the NetherlandsAmsterdam Centre for Global Child HealthEmma Children's HospitalAmsterdam UMCUniversity of AmsterdamAmsterdamthe Netherlands

Abstract

Objectives

To assess whether viral, bacterial, metabolic, and autoimmune diseases are missed by conventional diagnostics among children with severe acute encephalopathy in sub-Saharan Africa.

Study design

One hundred thirty-four children (6 months to 18 years) presenting with nontraumatic coma or convulsive status epilepticus to 1 of 4 medical referral centers in Uganda, Malawi, and Rwanda were enrolled between 2015 and 2016. Locally available diagnostic tests could be supplemented in 117 patients by viral, bacterial, and 16s quantitative polymerase chain reaction testing, metagenomics, untargeted metabolomics, and autoimmune immunohistochemistry screening.

Results

Fourteen (12%) cases of viral encephalopathies, 8 (7%) cases of bacterial central nervous system (CNS) infections, and 4 (4%) cases of inherited metabolic disorders (IMDs) were newly identified by additional diagnostic testing as the most likely cause of encephalopathy. No confirmed cases of autoimmune encephalitis were found. Patients for whom additional diagnostic testing aided causal evaluation (aOR 3.59, 90% CI 1.57-8.36), patients with a viral CNS infection (aOR 7.91, 90% CI 2.49-30.07), and patients with an IMD (aOR 9.10, 90% CI 1.37-110.45) were at increased risk for poor outcome of disease.

Conclusions

Viral and bacterial CNS infections and IMDs are prevalent causes of severe acute encephalopathy in children in Uganda, Malawi, and Rwanda that are missed by conventional diagnostics and are associated with poor outcome of disease. Improved diagnostic capacity may increase diagnostic yield and might improve outcome of disease.

Le texte complet de cet article est disponible en PDF.

Abbreviations : CMV, CNS, CSF, EBV, HHV, HSV, IMD, OMIM, qPCR


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 Funded by the Dutch Research Council (NWO). The funder/sponsor did not participate in the work. The authors report no conflict of interest.


© 2023  The Authors. Publié par Elsevier Masson SAS. Tous droits réservés.
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