Les données cliniques et thérapeutiques « de vie réelle » ont pris une place importante dans l’évaluation des produits de santé et des stratégies thérapeutiques, imposant la création de nouvelles plateformes dynamiques qui s'appuient sur les méthodes de big data et de « machine learning ». Dans ce contexte et dans le cadre d'un partenariat public-privé ouvert sous gouvernance scientifique académique, le « Onco Data Hub » (ODH) est un entrepôt de données de Santé (EDS) géré par Unicancer et constitué de données extraites à partir des données immédiatement disponibles dans les établissements de santé (ETS) prenant en charge des patients atteints de cancer en France.

La plateforme centralise plus de 60 variables clés (caractéristiques patients et maladie, traitements reçus, biomarqueurs, suivi du statut vital…) nativement structurées et collectées automatiquement via les logiciels de préparation des traitements anticancéreux parentéraux (CHIMIO®…) mais également des données issues du dossier médical des patients nécessitant l'usage d'outils de traitement automatique (NLP, RegEx) pour extraire la donnée recherchée. L'objectif est d'obtenir une base unique, structurée et exhaustive adaptée à de nombreux usages : description des populations cibles, étude d'efficacité… La collecte des données s'organise autour de deux campagnes annuelles avec l'intégration des données de patients nouvellement pris en charge ainsi que la mise à jour des patients déjà inclus lors des collectes précédentes. Les patients ayant eu une administration d'une thérapie anticancéreuse injectable au cours des six mois précédant l'extraction sont sélectionnés à partir du logiciel de préparation des traitements anticancéreux. Pour la première phase du projet, nous avons restreint la sélection aux patients ayant un diagnostic de cancer broncho-pulmonaire ou du sein. Une généralisation aux autres cancers est prévue ultérieurement. Les données collectées font systématiquement l'objet d'un contrôle visant à valider la qualité et la cohérence des données.

En 2022, 25 premiers ETS ont participé à l'acquisition des données. L'objectif est fixé à environ 60 ETS représentatifs (CHU, CH, CLCC, cliniques…) d'ici fin 2023. La base comptait, en novembre 2022, 30 953 patients traités dans l'un des 25 ETS contributeurs entre le 01/01/2020 et le 30/06/2022, dont 18 782 patients atteints d'un cancer du sein et 12 171 patients atteints d'un cancer broncho-pulmonaire. Les caractéristiques des patients, de leur maladie et de leur prise en charge sont déjà accessibles et seront présentées. Dans certains cas, la non-structuration des données a nécessité une collecte manuelle directement à partir du dossier patient source sur site. Un travail d'automatisation de la récupération de ces données est en cours avec les ETS permettant, en plus d'atteindre l'objectif d'automatisation complète du processus de recueil des données prévu pour ODH, de s'inscrire dans le processus d'optimisation des systèmes informatiques propre à chaque ETS.

Le programme ODH va contribuer à une meilleure compréhension des stratégies thérapeutiques « en vraie vie » en constituant à terme une nouvelle source de données récentes, riche, dynamique et représentative de la prise en charge des patients qui permettra de mener des projets de recherche académiques et de produire des données nécessaires aux laboratoires pharmaceutiques, aux institutions de santé impliquées dans l’évaluation des produits de santé et à la décision en santé publique.

Données de vie réelle; Cancer du sein; Cancer Broncho-pulmonaire; Epidémiologie; Base de données

Les auteurs n'ont pas précisé leurs éventuels liens d'intérêts.