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Machine learning-based scoring system to predict in-hospital outcomes in patients hospitalized with COVID-19 - 10/12/22

Doi : 10.1016/j.acvd.2022.08.003 
Orianne Weizman a, b, Baptiste Duceau b, Antonin Trimaille c, Thibaut Pommier d, Joffrey Cellier e, Laura Geneste f, Vassili Panagides g, Wassima Marsou h, Antoine Deney i, Sabir Attou j, Thomas Delmotte k, Sophie Ribeyrolles l, Pascale Chemaly m, Clément Karsenty i, Gauthier Giordano a, Alexandre Gautier m, Corentin Chaumont n, Pierre Guilleminot d, Audrey Sagnard d, Julie Pastier d, Nacim Ezzouhairi o, Benjamin Perin a, Cyril Zakine p, Thomas Levasseur q, Iris Ma e, Diane Chavignier r, Nathalie Noirclerc s, Arthur Darmon t, Marine Mevelec r, Willy Sutter b, Delphine Mika u, Charles Fauvel n, Théo Pezel v, Victor Waldmann b, e, 1, Ariel Cohen w, 1, 2, , Guillaume Bonnet b, e, 1

for the Critical COVID-19 France investigators

a Centre Hospitalier Régional Universitaire de Nancy, 54511 Vandoeuvre-lès-Nancy, France 
b Université de Paris, PARCC, INSERM, 75015 Paris, France 
c Nouvel Hopital Civil, Centre Hospitalier Régional Universitaire de Strasbourg, 67000 Strasbourg, France 
d Centre Hospitalier Universitaire de Dijon, 21000 Dijon, France 
e Hôpital Européen Georges-Pompidou, Université de Paris, 75015 Paris, France 
f Centre Hospitalier Universitaire d’Amiens-Picardie, 80000 Amiens, France 
g Centre Hospitalier Universitaire de Marseille, 13005 Marseille, France 
h GCS-Groupement des Hôpitaux de l’Institut Catholique de Lille, Faculté de Médecine et de Maïeutique, Université Catholique de Lille, 59800 Lille, France 
i Centre Hospitalier Universitaire de Toulouse, 31400 Toulouse, France 
j Centre Hospitalier Universitaire de Caen-Normandie, 14000 Caen, France 
k Centre Hospitalier Universitaire de Reims, 51100 Reims, France 
l Institut Mutualiste Montsouris, 75014 Paris, France 
m Institut Cardiovasculaire Paris Sud, 91300 Massy, France 
n Centre Hospitalier Universitaire de Rouen, FHU REMOD-VHF, 76000 Rouen, France 
o Centre Hospitalier Universitaire de Bordeaux, 33076 Bordeaux, France 
p Clinique Saint-Gatien, 37540 Saint-Cyr-sur-Loire, France 
q Centre Hospitalier Intercommunal Fréjus-Saint-Raphaël, 83600 Fréjus, France 
r Centre Hospitalier Régional de Orléans, 45100 Orléans, France 
s Centre Hospitalier Annecy Genevois, 74370 Épagny-Metz-Tessy, France 
t Hôpital Bichat-Claude-Bernard, AP–HP, Université de Paris, 75018 Paris, France 
u Université Paris-Saclay, Inserm, UMR-S 1180, 92296 Chatenay-Malabry, France 
v Hôpital Lariboisière, AP–HP, Université de Paris, 75010 Paris, France 
w Hôpital Saint-Antoine, 75012 Paris, France 

*Corresponding author. Hôpital Saint-Antoine, 184, Rue du Faubourg Saint-Antoine, 75012 Paris, France.Hôpital Saint-Antoine184, Rue du Faubourg Saint-AntoineParis75012France

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Highlights

Using machine learning techniques, the CCF risk score was developed to predict in-hospital outcomes in COVID-19.
All hospitalized COVID-19 patients from a nationwide multicentre observational study were included.
The CCF risk score aimed to estimate the risk of transfer to an intensive care unit or in-hospital death.
Eleven clinical and biological variables were selected with good calibration and discrimination.
The CCF risk score performed significantly better than the usual critical care risk scores.

Le texte complet de cet article est disponible en PDF.

Abstract

Background

The evolution of patients hospitalized with coronavirus disease 2019 (COVID-19) is still hard to predict, even after several months of dealing with the pandemic.

Aims

To develop and validate a score to predict outcomes in patients hospitalized with COVID-19.

Methods

All consecutive adults hospitalized for COVID-19 from February to April 2020 were included in a nationwide observational study. Primary composite outcome was transfer to an intensive care unit from an emergency department or conventional ward, or in-hospital death. A score that estimates the risk of experiencing the primary outcome was constructed from a derivation cohort using stacked LASSO (Least Absolute Shrinkage and Selection Operator), and was tested in a validation cohort.

Results

Among 2873 patients analysed (57.9% men; 66.6±17.0 years), the primary outcome occurred in 838 (29.2%) patients: 551 (19.2%) were transferred to an intensive care unit; and 287 (10.0%) died in-hospital without transfer to an intensive care unit. Using stacked LASSO, we identified 11 variables independently associated with the primary outcome in multivariable analysis in the derivation cohort (n=2313), including demographics (sex), triage vitals (body temperature, dyspnoea, respiratory rate, fraction of inspired oxygen, blood oxygen saturation) and biological variables (pH, platelets, C-reactive protein, aspartate aminotransferase, estimated glomerular filtration rate). The Critical COVID-19 France (CCF) risk score was then developed, and displayed accurate calibration and discrimination in the derivation cohort, with C-statistics of 0.78 (95% confidence interval 0.75–0.80). The CCF risk score performed significantly better (i.e. higher C-statistics) than the usual critical care risk scores.

Conclusions

The CCF risk score was built using data collected routinely at hospital admission to predict outcomes in patients with COVID-19. This score holds promise to improve early triage of patients and allocation of healthcare resources.

Le texte complet de cet article est disponible en PDF.

Keywords : COVID-19, SARS-CoV-2, Risk score, Prediction, Prognosis

Abbreviations : CCF, CI, COVID-19, CURB-65, ICU, IQR, LASSO, PREDICO, qSOFA, SARS-CoV-2, SOFA


Plan


 Tweet: A new machine learning-based risk score to predict in-hospital outcomes in patients hospitalized with COVID-19. The CCF risk score, based on 11 simple variables, can help predict outcomes, with an online calculator available.


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Vol 115 - N° 12

P. 617-626 - décembre 2022 Retour au numéro
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