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High-resolution transcriptomics of bovine purified protein derivative-stimulated peripheral blood from cattle infected with Mycobacterium bovis across an experimental time course - 22/09/22

Doi : 10.1016/j.tube.2022.102235 
Carolina N. Correia a, Gillian P. McHugo a, John A. Browne a, Kirsten E. McLoughlin a, Nicolas C. Nalpas a, 3, David A. Magee a, Adam O. Whelan b, 2, Bernardo Villarreal-Ramos b, 1, H. Martin Vordermeier b, 1, Eamonn Gormley c, Stephen V. Gordon c, d, David E. MacHugh a, d,
a Animal Genomics Laboratory, UCD School of Agriculture and Food Science, UCD College of Health and Agricultural Sciences, University College Dublin, Belfield, Dublin, D04 V1W8, Ireland 
b TB Immunology and Vaccinology Team, Department of Bacteriology, Animal and Plant Health Agency, Weybridge, Surrey, KT15 3NB, United Kingdom 
c UCD School of Veterinary Medicine, UCD College of Health and Agricultural Sciences, University College Dublin, Belfield, Dublin, D04 V1W8, Ireland 
d UCD Conway Institute of Biomolecular and Biomedical Research, University College Dublin, Belfield, Dublin, D04 V1W8, Ireland 

Corresponding author. Animal Genomics Laboratory, UCD School of Agriculture and Food Science, UCD College of Health and Agricultural Sciences, University College Dublin, Belfield, Dublin, D04 V1W8, Ireland..Animal Genomics LaboratoryUCD School of Agriculture and Food ScienceUCD College of Health and Agricultural SciencesUniversity College DublinBelfieldDublinD04 V1W8Ireland

Abstract

Objectives

Improved bovine tuberculosis (bTB) diagnostics with higher sensitivity and specificity are urgently required. A better understanding of the peripheral blood transcriptional response of Mycobacterium bovis-infected animals after bovine purified protein derivative (PPD-b) stimulation of whole blood—an important component of current bTB diagnostics—will provide new information for development of better diagnostics.

Methods

RNA sequencing (RNA-seq) was used to study the peripheral blood transcriptome after stimulation with PPD-b across four time points (−1 wk pre-infection, and +1 wk, +2 wk, and +10 wk post-infection) from a 14-week M. bovis infection time course experiment with ten age-matched Holstein-Friesian cattle.

Results

In vitro PPD-b stimulation of peripheral blood from M. bovis-infected and non-infected cattle elicited a strong transcriptional response. Comparison of PPD-b stimulated, and unstimulated samples revealed higher expression of genes encoding cytokine receptors, transcription factors, and interferon-inducible proteins. Lower expression was seen for genes encoding proteins involved in antimicrobial activity, C-type lectin receptors, inhibition of signal transduction, and genes encoding metal ion transporters.

Conclusions

A transcriptional signature associated with the peripheral blood response to PPD-b stimulation consisting of 170 genes was identified exclusively in the post-infection time points. Therefore, this represents a panel of potential biomarkers of M. bovis infection.

Le texte complet de cet article est disponible en PDF.

Keywords : Biomarker, Blood, Bovine tuberculosis, Diagnostics, Mycobacterium bovis, Transcriptomics


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