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Differential expression of the Mycobacterium tuberculosis heat shock protein genes in response to drug-induced stress - 28/05/22

Doi : 10.1016/j.tube.2022.102201 
Somanna Ajjamada Nachappa a, Sumana M. Neelambike b, Nallur B. Ramachandra a,
a Genetics and Genomics Lab, Department of Studies in Genetics and Genomics, University of Mysore, Mysuru, India 
b Department of Microbiology, JSS Medical College and Hospital, Mysuru, India 

Corresponding author. Department of Studies in Genetics and Genomics University of Mysore, Mysuru, 570006, India.Department of Studies in Genetics and Genomics University of MysoreMysuru570006India

Abstract

Heat shock proteins are essential in maintaining cellular protein function, especially during stress. Their influence in managing drug-induced stress in Tuberculosis is not clearly understood.

Aims

Study the expression of select genes of the DnaK/ClpB chaperone network to evaluate their role in stress response in Mycobacterium tuberculosis clinical isolates during exposure to Isoniazid (INH) and Rifampicin (RIF).

Methods

Sanger sequencing to detect drug-resistant mutations followed by Drug Susceptibility Testing and Minimum Inhibitory Concentration determination. Culturing the bacilli in vitro, exposed to 1/4, 1/2 and 1 × MIC, and RNA quantification of dnaK, dnaJ1, grpE and clpB genes by using Real-time PCR.

Results

Susceptible isolates showed marginal down-regulation of two genes for INH, whereas all genes under-expressed against RIF. INH-resistant isolates had distinct expression profiles for inhA-15 and katG315 mutants. RIF-resistant bacilli did not have significant differential expression. MDR isolate showed up-regulation of all the four genes, with two genes over-expressing (≥4-fold).

Conclusions

We observed characteristic gene expression profiles for each isolate in response to lethal and sub-lethal doses of INH and RIF. This provides insight into the role of DnaK/ClpB chaperone network in managing drug-induced stress and facilitating resistance. Further, the knowledge could provide targets for new drugs and augmenters.

Le texte complet de cet article est disponible en PDF.

Highlights

Role of DnaK/ClpB chaperone network in managing drug-induced stress in Tuberculosis.
HSP gene expression in katG-mutant Mycobacterium correlated to drug dosage.
DnaK/ClpB linked pathway not triggered in RIF-resistant isolate on drug exposure.
Over-expression of dnaK and grpE in INH/RIF treated MDR Tuberculosis isolate.

Le texte complet de cet article est disponible en PDF.

Keywords : Tuberculosis, Heat shock protein, Drug resistance, Gene expression


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Vol 134

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