Le premier data challenge organisé par la Société Française de Pathologie : une compétition internationale en 2020, un outil de recherche en intelligence artificielle pour l’avenir ? - 08/04/22
The first data challenge of the french society of pathology: An international competition in 2020, a research tool in A.I. for the future?
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Résumé |
La Société française de pathologie (SFP) a organisé en 2020 son premier data challenge avec le soutien du Health Data Hub (HDH). La préparation de cet évènement a d’abord comporté une phase de recrutement de près de 5000 lames de biopsies du col utérin auprès de 20 centres volontaires. Après s’être assuré de l’absence d’opposition des patientes, les lames ont été anonymisées, numérisées, annotées par des pathologistes et finalement mises à disposition de compétiteurs du monde entier sur une plateforme dédiée. Les équipes en compétition devaient développer des algorithmes permettant de distinguer les 4 classes diagnostiques des lésions épithéliales du col utérin. Plus de 500 compétiteurs ont développé plusieurs dizaines d’algorithmes et les meilleurs d’entre eux ont atteint des scores proche de 95 % de reconnaissance des lésions. Les 3 meilleures équipes se sont partagées 25 000€ de prix à l’occasion d’une session pendant Carrefour Pathologie Digital 2020. Au-delà de cette compétition, dont la partie finale s’est tenue sur une période de quelques semaines, la SFP et le HDH travaillent maintenant au maintien en ligne et en accès ouvert sur le long terme de cette collection afin de permettre à la communauté des data scientists et des pathologistes de poursuivre leurs progrès en intelligence artificielle dans ce champ thématique.
Le texte complet de cet article est disponible en PDF.Summary |
The french society of pathology (SFP) organized in 2020 its first data challenge with the help of Health Data Hub (HDH). The organisation of this event first consisted in recruiting almost 5000 slides of uterus cervical biopsies obtained in 20 pathology centers. After having made sure that patients did not refuse to include their slides in the project, the slides were anonymised, digitized and annotated by expert pathologists, and were finally uploaded on a data challenge platform for competitors all around the world. Competitors teams had to develop algorithms that could distinguish among four diagnostic classes in epithelial lesions of uterine cervix. Among many submissions by competitors, the best algorithms obtained an overall score close to 95%. The best 3 teams shared 25k€ prizes during a special session organised during the national congress of the SFP. The final part of the competition lasted only 6 weeks and the goal of SFP and HDH is now to allow for the collection to be published in open access. This final step will allow data scientists and pathologists to further develop artificial intelligence algorithms in this medical area.
Le texte complet de cet article est disponible en PDF.Mots clés : Intelligence artificielle, Data challenge, Lames virtuelles, Col utérin
Keywords : Artificial intelligence, Data challenge, Whole slide images, Uterine cervix
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Vol 42 - N° 2
P. 119-128 - mars 2022 Retour au numéroBienvenue sur EM-consulte, la référence des professionnels de santé.
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