Le groupe sanguin Lutheran (LU), aux antigènes principaux Lua et Lub, est codé par BCAM (molécule d’adhésion basale cellulaire). Les protéines Lu/BCAM ont des propriétés d’adhésion et de médiation de la signalisation intracellulaire. Les hématies des drépanocytaires ont des niveaux élevés de Lua et Lub ce qui pourrait participer à la vaso-occlusion via l’adhérence des hématies falciformes à la chaîne α-5 de la laminine.

Lu/BCAM est composé d’un peptide signal, clivé, de 5 domaines de types immunoglobuline (D1 à D5) extracellulaires, d’un unique segment transmembranaire (TM) qui sert à sa dimérisation, et d’un domaine intracellulaire court, fortement désordonné. Dans un précédent travail, nous avions caractérisé la dimérisation et l’orientation du segment transmembranaire (El Nemer et al., J Biol Chem, 2019). Ici, nous proposons un modèle 3D entier du Lu/BCAM.

D1 et D2 sont disponibles, cristallisées (Protein DataBank 2PET). La modélisation de D4 et D5 s’est basée sur la structure de CD146 (pdb 6LYN) et celle de D3 sur la neurotrimine (pdb 6DLF). Le segment TM a été construit à l’aide d’un segment TM compatible. La partie intracellulaire a été générée par le logiciel RaptorX.

Chaque région a été réalignée avec son support et comparée aux prédictions de structures secondaires. Des contraintes ont été ajoutées pour les ponts disulfures et la topologie des boucles connectantes, la plupart ne disposant pas de support structural. La multiplication des étapes de raffinage et d’analyse permet de proposer un modèle final de qualité (voir Figure 1). Celui-ci permet d’observer les différents antigènes du groupe sanguin Lu, révélant que les résidus impliqués sont exposés.