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Ex-vivo immunophenotyping and high dimensionality UMAP analysis of leucocyte subsets in tuberculous lymphadenitis - 23/09/21

Doi : 10.1016/j.tube.2021.102117 
Gokul Raj Kathamuthu a, , Nathella Pavan Kumar b, Rathinam Sridhar c, Dhanaraj Baskaran b, Subash Babu a, d
a National Institutes of Health-NIRT-International Center for Excellence in Research, Chennai, India 
b National Institute for Research in Tuberculosis (NIRT), Chennai, India 
c Government Stanley Medical Hospital, Chennai, India 
d Laboratory of Parasitic Diseases, National Institute of Allergy and Infectious Diseases, National Institutes of Health, Bethesda, MD, USA 

Corresponding author. NIH-ICER, National Institute for Research in Tuberculosis, Chennai, India.NIH-ICERNational Institute for Research in TuberculosisChennaiIndia

Abstract

Tuberculous lymphadenitis (TBL) is defined by reduced proinflammatory cytokines and elevated CD4+, CD8+ T cells and decreased CD8+ cytotoxic markers. However, ex-vivo phenotyping of diverse leucocytes in TBL has not been done. We show activated and atypical B cells, myeloid dendritic cells (mDCs), classical, non-classical and intermediate monocytes, T regulatory (T regs) cells, CD4+ T cell effector memory RA (TEMRA), CD4+ effector and CD8+ central memory phenotypes were significantly increased in TBL compared to LTB individuals. In contrast, classical memory and plasma B cells, plasmacytoid DCs (pDCs), CD8+ TEMRA, CD4+ naïve and central memory cells were significantly decreased in TBL compared to LTB individuals. Some of the leucocyte frequencies (atypical memory B cells, pDCs, myeloid-derived suppressor cells, CD4+ effector and CD8+ central memory was increased; activated memory and plasma B cell, mDCs, classical, non-classical, intermediate monocytes, T regs, CD4+ TEMRA, CD4+, CD8+ naïve and effector memory cells and CD8+ central memory cells were decreased) were significantly modulated after anti-TB treatment among TBL individuals. UMAP analysis show that leucocyte subsets or islands expressing specific markers were significantly different in TBL baseline and post-treatment individuals. Overall, we suggest altered frequencies of diverse leucocytes influences the disease pathology and protective immunity in TBL individuals.

Le texte complet de cet article est disponible en PDF.

Keywords : Monocytes, T regs, UMAP analysis, Flow cytometry, B cells, Memory T cells, Dendritic cells


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