Pendant la période de la reproduction, l'endomètre subit des modifications morphologiques et physiologiques caractérisées par une croissance, une différenciation sécrétoire et, en l'absence de fécondation, une menstruation et une régénération. Ces modifications morphologiques de l'endomètre sont sous le contrôle des estrogènes et de la progestérone sécrétés par l'ovaire, et des facteurs de croissance et des enzymes synthétisés par ces hormones. L'action des estrogènes et de la progestérone se fait par l'intermédiaire de récepteurs spécifiques présents dans le noyau des cellules de l'épithélium et du stroma de l'endomètre. Les estrogènes stimulent la synthèse de ces récepteurs. La progestérone inhibe leur synthèse. Les estrogènes permettent la prolifération de la muqueuse pendant la phase proliférative. Ils sont également responsables de la synthèse des récepteurs de la progestérone et préparent ainsi la phase sécrétoire. Cette phase sécrétoire est sous l'influence de la progestérone. Ces modifications cycliques ont pour finalité de créer un environnement adapté pour la nidation. La compréhension des modifications morphologiques au niveau de l'endomètre durant le cycle menstruel est importante à connaître car elle permet de confirmer que l'axe hypothalamo-hypophysaire-ovarien fonctionne normalement. L'évaluation morphologique de l'endomètre permet également une meilleure compréhension des mécanismes d'action des hormones au niveau cellulaire.