L’infection liée au SARS-CoV-2 entraîne des lésions qui prédominent largement, mais pas exclusivement, au niveau de l’arbre respiratoire. Leur analyse a largement bénéficié des études autopsiques. Ainsi, des lésions ont pu être observées dans les différents organes, tissus ou cellules de l’organisme. Ces observations ont permis d’améliorer rapidement la connaissance des différents mécanismes physiopathologiques associés à cette maladie émergente. Le virus et ses différentes composantes peuvent être détectés à partir de tissus fixés et inclus en paraffine, par immunohistochimie, hybridation in situ, biologie moléculaire et/ou microscopie électronique. Plusieurs inconnues persistent sur le rôle direct joué par le SARS-CoV-2 dans les différentes lésions observées, notamment au niveau cardiaque, cérébral, hépatique, digestif, cutané et rénal. Il est donc primordial de multiplier les analyses tissulaires et cellulaires chez ces patients afin de mieux comprendre les conséquences de la maladie liée à la COVID-19, en particulier selon les facteurs épidémiologiques et les co-morbidités. La connaissance de cette maladie doit permettre, plus particulièrement, de participer au développement des stratégies thérapeutiques. Cette revue décrit les principales lésions histologiques et cellulaires associées à l’infection par le SARS-CoV-2.

The infection due to the SARS-CoV-2 leads lesions mainly observed at the respiratory tract level, but not exclusively. The analyses of these lesions benefited from different autopsy studies. Thus, these lesions were observed in different organs, tissues and cells. These observations allowed us to rapidly improve the knowledge of the pathophysiological mechanisms associated with this emergent infectious disease. The virus can be detected in formalin fixed paraffin embedded tissues using immunohistochemistry, in situ hybridization, molecular biology and/or electron microscopy approaches. However, many uncertainties are still present concerning the direct role of the SARS-CoV-2 on the different lesions observed in different organs, outside the lung, such as the heart, the brain, the liver, the gastrointestinal tract, the kidney and the skin. In this context, it is pivotal to keep going to increase the different tissue and cellular studies in the COVID-19 positive patients aiming to better understanding the consequences of this new infectious disease, notably considering different epidemiological and co-morbidities associated factors. This could participate to the development of new therapeutic strategies too. The purpose of this review is to describe the main histological and cellular lesions associated with the infection due to the SARS-CoV-2.