Le microbiote intestinal joue un rôle fondamental dans la pathogénie des maladies inflammatoires chroniques de l’intestin (Mici), et de nombreux travaux chez l’animal et l’humain retrouvent ce concept de dysbiose intestinale, à la fois pour le microbiote bactérien, mais probablement également pour le microbiote fongique et viral. De nombreuses études retrouvent une modification du microbiote bactérien chez les patients atteints de Mici, caractérisé par une réduction de la diversité bactérienne, avec une diminution du phylum des Firmicutes (dont notamment Faecalibacterium prausnitzii) et une augmentation du phylum des Proteobacteria. Les études actuelles sur la transplantation de microbiote intestinal devraient permettre de mieux comprendre le rôle de la dysbiose dans ces pathologies.

The gut microbiota might play an active role in pathogenesis of Inflammatory Bowel Diseases, and many studies in animals et humans showed the influence of dysbiotic microbiota, bacterial microbiota, but also fungal and viral intestinal microbiota. A lot of studies observed a bacterial dysbiotic in IBD patients, characterised by a reduced bacterial diversity, a decrease in some bacteria belonging to the Firmicutes phylum (such as Faecalibacterium prausnitzii) and an increase of the Proteobacteria phylum. Studies in fecal microbiota transplantation should allow better understanding the role of intestinal dysbiotic in IBDs.