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SARS-CoV-2 detection, viral load and infectivity over the course of an infection - 06/08/20

Doi : 10.1016/j.jinf.2020.06.067 
Kieran A. Walsh a, , Karen Jordan a, Barbara Clyne a, b, Daniela Rohde a, Linda Drummond a, Paula Byrne a, Susan Ahern a, Paul G. Carty a, Kirsty K. O'Brien a, Eamon O'Murchu a, Michelle O'Neill a, Susan M. Smith b, Máirín Ryan a, c, 1, Patricia Harrington a, 1
a Health Information and Quality Authority, Smithfield, Dublin 7, Ireland 
b Health Research Board Centre for Primary Care Research, Department of General Practice, Royal College of Surgeons in Ireland, 123 St Stephens Green, Dublin 2, Ireland 
c Department of Pharmacology & Therapeutics, Trinity College Dublin, Trinity Health Sciences, James Street, Dublin 8, Ireland 

Corresponding author at: Health Information and Quality Authority, Unit 1301, City Gate, Mahon T12 Y2XT, Cork, Ireland.Health Information and Quality AuthorityUnit 1301, City GateMahonCorkT12 Y2XTIreland

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Highlights

SARS-CoV-2 viral loads peak from upper respiratory tract samples around symptom onset.
Viral loads from sputum samples may be higher than upper respiratory tract samples.
Viral loads appear to be similar between asymptomatic and symptomatic patients.
The prolonged virus detection in stool samples has unclear clinical significance.
Patients may not be infectious for the entire duration of virus detection.

Le texte complet de cet article est disponible en PDF.

Summary

Objectives

To summarise the evidence on the detection pattern and viral load of SARS-CoV-2 over the course of an infection (including any asymptomatic or pre-symptomatic phase), and the duration of infectivity.

Methods

A systematic literature search was undertaken in PubMed, Europe PubMed Central and EMBASE from 30 December 2019 to 12 May 2020.

Results

We identified 113 studies conducted in 17 countries. The evidence from upper respiratory tract samples suggests that the viral load of SARS-CoV-2 peaks around symptom onset or a few days thereafter, and becomes undetectable about two weeks after symptom onset; however, viral loads from sputum samples may be higher, peak later and persist for longer. There is evidence of prolonged virus detection in stool samples, with unclear clinical significance.

No study was found that definitively measured the duration of infectivity; however, patients may not be infectious for the entire duration of virus detection, as the presence of viral ribonucleic acid may not represent transmissible live virus.

Conclusion

There is a relatively consistent trajectory of SARS-CoV-2 viral load over the course of COVID-19 from respiratory tract samples, however the duration of infectivity remains uncertain.

Le texte complet de cet article est disponible en PDF.

Keywords : Coronavirus, COVID-19, SARS-CoV-2, Viral load, Infectivity, RNA, Review


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Vol 81 - N° 3

P. 357-371 - septembre 2020 Retour au numéro
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