La vérification de la PCR-RT pour la détection et la discrimination entre Bordetella pertussis, Bordetella parapertussis et Bordetella holmesii pour le diagnostic de la coqueluche - 04/08/20
Verification of real-time PCR for detection of and discrimination between Bordetella pertussis, Bordetella parapertussis, and Bordetella holmesii for diagnosis of pertussis
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Résumé |
Contexte et objectif |
La coqueluche continue de provoquer une maladie grave et des décès chez les nouveau-nés et les nourrissons trop jeunes. La technique de PCR est de plus en plus utilisée comme test de diagnostic direct pour le diagnostic de la Coqueluche, la connaissance des performances de la méthode analytique utilisée au laboratoire est essentielle pour vérifier la fiabilité des résultats. L’objectif de cette étude est de vérifier les performances de la technique de PCR-RT multiplex, utilisée au laboratoire pour le diagnostic de la coqueluche, en déterminant sa sensibilité, sa spécificité, sa valeur prédictive positive et négative.
Matériels et méthodes |
Un total de 12 bactéries non-Bordetella a été inclus dans l’étude de la spécificité. Onze échantillons sont positifs pour les 3 espèces : Bordetella pertussis, Bordetella parapertussis et Bordetella holmesii ont été inclus dans l’étude de la sensibilité. La recherche de l’ADN des 3 espèces est réalisée par PCR-RT multiplex.
Résultats |
La sensibilité de la PCR est de 100 %, la spécificité de la PCR est de 100 %. La valeur prédictive négative et la valeur prédictive positive sont de 100 %. Une PCR en temps réel ciblant B. pertussis, B. parapertussis et B. holmesii s’est avérée spécifique et utile pour confirmer la présence de la séquence d’insertion 481, IS1001 et hIS1001.
Conclusion |
On conclut que les performances de la technique de PCR-RT répondent aux exigences du laboratoire des maladies épidémiques pour le diagnostic de la coqueluche.
Le texte complet de cet article est disponible en PDF.Summary |
Background and objective |
Pertussis continues to cause serious illness and death in newborns and infants who are too young. The PCR technique is increasingly used as a direct diagnostic test for the diagnosis of Pertussis, knowledge of the performance of the analytical method used in the laboratory is essential to verify the reliability of the results. The objective of this study is to verify the performance of the PCR-RT multiplex technique, used in the laboratory for the diagnosis of pertussis, by determining its sensitivity, its specificity, its positive and negative predictive value.
Materials and methods |
A total of 12 non-Bordetella bacteria were included in the specificity study. Eleven samples are positive for the 3 species: Bordetella pertussis, Bordetella parapertussis and Bordetella holmesii were included in the sensitivity study. The DNA research of the 3 species is carried out by multiplex PCR-RT.
Results |
The sensitivity of the PCR is 100%, the specificity of the PCR is 100%. The negative predictive value and the positive predictive value are 100%. A real-time PCR targeting B. pertussis, B. parapertussis and B. holmesii was found to be specific and useful for confirming the presence of the insertion sequence 481, IS1001 and hIS1001.
Conclusion |
It is concluded that the performance of the PCR-RT technique meets the requirements of the epidemic disease laboratory for the diagnosis of pertussis.
Le texte complet de cet article est disponible en PDF.Mots clés : PCR-RT, B. pertussis, Coqueluche, Spécificité, Sensibilité
Keywords : PCR-RT, B. pertussis, Pertussis, Specificity, Sensibility
Plan
Vol 33 - N° 4
P. 193-197 - août 2020 Retour au numéroBienvenue sur EM-consulte, la référence des professionnels de santé.
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