Le nombre de patients atteints de nocardiose dans le monde est en constante augmentation. En raison de la nature et de la gravité de cette infection, l’identification rapide et précise des Nocardia est capitale. Les techniques conventionnelles de diagnostic (chimiotaxonomiques, biochimiques, physiologiques et morphologiques) ne permettent plus qu’une approche diagnostique présomptive. Des techniques moléculaires d’identification des Nocardia sont actuellement proposées aux laboratoires de microbiologie pour détecter plus rapidement et identifier les différentes espèces de Nocardia.

Après le développement de techniques d’hybridation moléculaire, de ribotypage et de PCR-RFLP, les techniques de séquençage de l’ARNr 16S sont maintenant les plus utilisées pour l’identification des Nocardia mais dépendent de la soumission des séquences dans les bases de données accessibles au public. Les bases de données RIDOM, MicroSeq et BIBI ont été développées pour les genres Mycobacterium et Nocardia. Cette dernière base de données se présente sous la forme d’un outil ergonomique puissant d’aide à l’analyse des résultats et à la prise de décision pour l’identification bactérienne. Cette base de données est à la disposition de la communauté scientifique internationale sur le Web ( cliquez ici).

The number of patients suffering from nocardiosis is in constant increase in the world. Because of the nature and severity of this infection, the rapid and precise identification of Nocardia species is essential. Conventional techniques of diagnosis (chimiotaxonomic, biochemical, physiological, and morphological) allow only a presumptive diagnostic approach. Molecular techniques of identification of Nocardia are currently proposed to microbiological laboratories to detect more quickly and to identify the various species of Nocardia.

After the development of techniques of molecular hybridization, ribotypage and PCR - RFLP, 16S rRNA sequencing techniques are now used for the identification of Nocardia but depend on the tender of the sequences in the databases accessible to the public. Data bases RIDOM, MicroSeq and BIBI were developed for Mycobacterium and Nocardia genera. The BIBI database is a powerful and ergonomic tool that helps to analyse the results and the decision-making for bacterial identification. This database is freely accessible to the international scientific community on the Web ( cliquez ici).