De nombreux agents infectieux sont responsables de troubles neurologiques, et leurs mécanismes de pathogénicité sont variables. Les manifestations neurologiques, selon le site de la lésion et le germe impliqué, peuvent être centrales (encéphaliques, médullaires) ou périphériques (radiculaires, plexiques, tronculaires, plaques motrices, muscles). Les troubles sont consécutifs à une lésion directe (action cytopathogène), ou un mécanisme dysimmunitaire (syndromes neurologiques post-infectieux). Dans certains cas, la maladie est due à une réactivation d'un micro-organisme resté en latence après une primo-infection, ou à l'opportunisme d'un agent infectieux en contexte d'immunodépression. L'anamnèse du patient (mode d'installation, notion de voyage, etc.) et l'examen clinique permettent d'orienter le diagnostic. Les examens complémentaires à disposition sont variés, allant de l'imagerie (scanner, imagerie par résonance magnétique), l'électrophysiologie (électroencéphalogramme, électromyogramme), aux analyses biologiques (ponction lombaire afin d'étudier le liquide cérébrospinal, sérum, lésion lorsqu'elle est accessible à une ponction, etc.). Cette revue a pour objectif de détailler les manifestations neurologiques des pathogènes les plus fréquemment responsables de lésion du système nerveux et musculaire.