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Circulation, Evolution and Transmission of H5N8 virus, 2016–2018 - 19/09/19

Doi : 10.1016/j.jinf.2019.07.005 
Jianjun Chen a, b, c, 1, , Bilin Liang a, b, d, 1, Juefu Hu a, b, Haizhou Liu a, b, Jianqing Sun e, Mingxin Li a, Quanjiao Chen a, c, Yubang He e, Di Liu a, b, c, d,
a CAS Key Laboratory of Special Pathogens and Biosafety, Wuhan Institute of Virology, Chinese Academy of Sciences, Wuhan 430071, China 
b National Virus Resource Center, Wuhan Institute of Virology, Chinese Academy of Sciences, Wuhan 430071, China 
c Center for Influenza Research and Early warning (CASCIRE), Chinese Academy of Sciences, Beijing 100101, China 
d University of Chinese Academy Sciences, Beijing 101409, China 
e Qinghai Lake National Nature Reserve, Xining 810099, China 

Corresponding authors at: Wuhan Institute of Virology, Chinese Academy of Sciences, 44 Xiaohongshan, Wuhan, Hubei 430071, P.R. China.Wuhan Institute of VirologyChinese Academy of Sciences44 XiaohongshanWuhanHubei430071China

Highlights

The H5N8 was introduced into Qinghai Lake, with distinct genotype in 2016 and 2017.
LPAIVs in wild birds contributed to the high diversity of global H5N8 viruses.
The major reassortment events may occur during 2016–2017.
Continued circulation among wild birds resulted in the global distribution.

Le texte complet de cet article est disponible en PDF.

Summary

Objectives

A second wave of highly pathogenic avian influenza A virus (HPAIV) H5N8 clade 2.3.4.4 has spread globally, causing outbreaks among wild birds and domestic poultry since autumn 2016. The circulation and evolutionary dynamics of the virus remain largely unknown.

Methods

We performed surveillance for H5N8 in Qinghai Lake in China since the emergence of the virus (from 2016 to 2018). By analyzing recovered viruses in Qinghai Lake and all related viruses worldwide (449 strains), we identified the genotypes, estimated their genesis and reassortment, and evaluated their global distribution and transmission.

Results

Through surveillance of wild migratory birds around Qinghai Lake between 2016 and 2018, we revealed that the H5N8 was introduced into Qinghai Lake bird populations (QH-H5N8), with distinct gene constellations in 2016 and 2017. A global analysis of QH-H5N8-related viruses showed that avian influenza viruses with low pathogenicity in wild birds contributed to the high diversity of genotypes; the major reassortment events possibly occurred during the 2016 breeding season and the following winters.

Conclusions

Continued circulation of QH-H5N8-related viruses among wild birds has resulted in the global distribution of high genotypic diversity. Thus, these viruses pose an ongoing threat to wild and domestic bird populations and warrant continuous surveillance.

Le texte complet de cet article est disponible en PDF.

Keywords : H5N8 avian influenza, Circulation, Evolution, Transmission, Migratory birds


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Vol 79 - N° 4

P. 363-372 - octobre 2019 Retour au numéro
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