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Tuberculosis

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Direct detection of Mycobacterium tuberculosis in clinical samples by a dry methyl green loop-mediated isothermal amplification (LAMP) method - 02/08/19

Doi : 10.1016/j.tube.2019.05.004 
Jeewan Thapa a, ⁎, 1 , Bhagwan Maharjan b, c, d, 1, Meena Malla e, Yukari Fukushima b, Ajay Poudel f, Basu Dev Pandey g, Kyoko Hyashida h, Stephen V. Gordon i, j, Chie Nakajima b, j, Yasuhiko Suzuki b, j, ⁎
a Department of Medical Laboratory Sciences, Faculty of Health Sciences, Hokkaido University, Kita-12 Nishi-5, Kita-ku, Sapporo, Hokkaido, 060-0812, Japan 
b Division of Bioresources, Hokkaido University Research Center for Zoonosis Control, Kita 20 Nishi 10, Kita-ku, Sapporo, Hokkaido, 001-0020, Japan 
c German Nepal Tuberculosis Project, Kalimati, Kathmandu, Nepal 
d Healthy Nepal, Balkhu, Kathmandu, Nepal 
e Shi-Gan International College of Science and Technology, Kathmandu, Nepal 
f Department of Microbiology, Chitwan Medical College Teaching Hospital, Chitwan, Nepal 
g Ministry of Health and Population, Kathmandu, Nepal 
h Division of Collaboration and Education, Hokkaido University Research Center for Zoonosis Control, Kita 20 Nishi 10, Kita-ku, Sapporo, Hokkaido, 001-0020, Japan 
i UCD School of Veterinary Medicine, University College Dublin, Dublin, D04 W6F6, Ireland 
j The Global Station for Zoonosis Control, Hokkaido University Global Institution for Collaborative Research and Education, Kita 20 Nishi 10, Kita-ku, Sapporo, Japan 

∗Corresponding author. Department of Medical Laboratory Sciences, Faculty of Health Sciences, Hokkaido University, Kita-12 Nishi-5, Kita-ku, Sapporo, Hokkaido, 060-0812, Japan.Department of Medical Laboratory SciencesFaculty of Health SciencesHokkaido UniversityKita-12 Nishi-5, Kita-ku, SapporoHokkaido060-0812Japan∗∗Corresponding author. Division of Bioresources, Hokkaido University Research Center for Zoonosis Control, Kita 20 Nishi 10, Kita-ku, Sapporo, Hokkaido, 001-0020, Japan.Division of BioresourcesHokkaido University Research Center for Zoonosis ControlKita 20 Nishi 10, Kita-ku, SapporoHokkaido001-0020Japan

Abstract

The purpose of this study was to develop a simple visual methyl green (MeG) based dry loop-mediated isothermal amplification (LAMP) method for early detection of Mycobacterium tuberculosis (MTB) from clinical samples. We identified MeG as an indicator of a positive LAMP reaction, where a positive reaction gave a blue-green color while a negative reaction was colorless. The MeG MTB-LAMP system was further simplified by drying all reagents for ease of use, and was then validated for its ability to diagnose TB directly using Nepalese clinical samples. We evaluated the dry MeG MTB-LAMP with 69 new TB suspected samples from patients that did not have a confirmed history of TB treatment and found the sensitivity in culture positive samples as 92.8% (13/14) and specificity in culture negative samples as 96.3% (53/55). Our LAMP system has the potential to be a point of care test for early diagnosis of active TB in developing countries.

Le texte complet de cet article est disponible en PDF.

Keywords : Loop mediated isothermal amplification (LAMP), Methyl green, Mycobacterium tuberculosis, Tuberculosis

Abbreviations : MTB-LAMP, Tuberculosis, MeG, POC


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Vol 117

P. 1-6 - juillet 2019 Retour au numéro
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  • A structural insight of bedaquiline for the cardiotoxicity and hepatotoxicity
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  • Proposition of a safe Mycobacterium tuberculosis complex denaturation method that does not compromise the integrity of DNA for whole-genome sequencing
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