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An Age-Based Framework for Evaluating Genome-Scale Sequencing Results in Newborn Screening - 23/05/19

Doi : 10.1016/j.jpeds.2018.12.027 
Laura V. Milko, PhD 1, Julianne M. O'Daniel, MS 1, Daniela M. DeCristo, BS 1, Stephanie B. Crowley, PhD 1, Ann Katherine M. Foreman, MS 1, Kathleen E. Wallace, BS 1, Lonna F. Mollison, PhD 1, Natasha T. Strande, PhD 1, 2, Zahra S. Girnary, MS 1, , Lacey J. Boshe, BS 1, , Arthur S. Aylsworth, MD 3, Muge Gucsavas-Calikoglu, MD 3, Dianne M. Frazier, MD 3, Neeta L. Vora, MD 4, Myra I. Roche, MS 1, 3, Bradford C. Powell, MD, PhD 1, Cynthia M. Powell, MD 1, 3, Jonathan S. Berg, MD, PhD 1,
1 Department of Genetics, UNC Chapel Hill, Chapel Hill, NC 
2 Department of Pathology and Laboratory Medicine, UNC Chapel Hill, Chapel Hill, NC 
3 Department of Pediatrics, Division of Genetics and Metabolism, UNC Chapel Hill, Chapel Hill, NC 
4 Department of Obstetrics and Gynecology, UNC Chapel Hill, Chapel Hill, NC 

Reprint requests: Jonathan S. Berg, MD, PhD, Department of Genetics, The University of North Carolina at Chapel Hill, 120 Mason Farm Rd, Chapel Hill, NC 27599-7264.Department of GeneticsThe University of North Carolina at Chapel Hill120 Mason Farm RdChapel HillNC27599-7264

Abstract

Objective

To assess the performance of a standardized, age-based metric for scoring clinical actionability to evaluate conditions for inclusion in newborn screening and compare it with the results from other contemporary methods.

Study design

The North Carolina Newborn Exome Sequencing for Universal Screening study developed an age-based, semiquantitative metric to assess the clinical actionability of gene–disease pairs and classify them with respect to age of onset or timing of interventions. This categorization was compared with the gold standard Recommended Uniform Screening Panel and other methods to evaluate gene–disease pairs for newborn genomic sequencing.

Results

We assessed 822 gene–disease pairs, enriched for pediatric onset of disease and suspected actionability. Of these, 466 were classified as having childhood onset and high actionability, analogous to conditions selected for the Recommended Uniform Screening Panel core panel. Another 245 were classified as having childhood onset and low to no actionability, 25 were classified as having adult onset and high actionability, 19 were classified as having adult onset and low to no actionability, and 67 were excluded due to controversial evidence and/or prenatal onset.

Conclusions

This study describes a novel method to facilitate decisions about the potential use of genomic sequencing for newborn screening. These categories may assist parents and physicians in making informed decisions about the disclosure of results from voluntary genomic sequencing in children.

Le texte complet de cet article est disponible en PDF.

Keywords : genetics, actionability, disclosure, decision-making, NSIGHT, NC NEXUS, NGS-NBS, ASQM

Abbreviations : ASQM, NBS, NC NEXUS, NGS, NGS-NBS, PCD, RUSP, SQM


Plan


 Funded by Eunice Kennedy Shriver National Institute of Child Health and Human Development and the National Human Genome Research Institute, United States (NICH D) U19 HD077632. J.B. is a recipient of the UNC Yang Family Biomedical Scholars Award. The authors declare no conflicts of interest.


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Vol 209

P. 68-76 - juin 2019 Retour au numéro
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