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Comparative evaluation of Xpert MTB/RIF assay with multiplex polymerase chain reaction for the diagnosis of tuberculous meningitis - 15/01/19

Doi : 10.1016/j.tube.2018.09.002 
Kusum Sharma a, , 1 , Megha Sharma a, 1, Lokesh Chaudhary b, Manish Modi b, 1, Manoj Goyal b, Navneet Sharma c, Aman Sharma c, Anumiti Jain b, Deba Prasad Dhibar c, Kajal Jain d, Niranjan Khandelwal e, Pallab Ray a, Vivel Lal b, Max Salfinger f
a Department of Medical Microbiology, Post Graduate Institute of Medical Education and Research, Chandigarh, India 
b Department of Neurology, Post Graduate Institute of Medical Education and Research, Chandigarh, India 
c Department of Internal Medicine, Post Graduate Institute of Medical Education and Research, Chandigarh, India 
d Department of Anaesthesiology, Post Graduate Institute of Medical Education and Research, Chandigarh, India 
e Department of Radiodiagnosis, Post Graduate Institute of Medical Education and Research, Chandigarh, India 
f Department of Medicine & Mycobacteriology Laboratory, National Jewish Health, Denver, CO, USA 

Corresponding author.

Abstract

Background

Rapid and specific diagnosis of tuberculous meningitis (TBM) is of paramount importance to decrease morbidity and mortality. Therefore, the present study was undertaken to compare the efficacy of Xpert MTB/RIF assay (GXpert) and multiplex PCR (MPCR) using three targets (IS6110, MPB64 and protein B) for diagnosing tuberculous meningitis.

Methods

GXpert and MPCR were performed on cerebrospinal fluid samples of 225 patients out of which 80 were culture-positive confirmed cases of TBM, 100 were ‘suspected’ cases of TBM and 45 were non-TBM controls. rpoB gene sequencing was done for diagnosing rifampicin (Rif) resistance in all positive cases.

Results

GXpert and MPCR were positive in 91/180 (50.5%) and 157/180 (87.2%) confirmed or suspected TBM patients respectively. Both the tests were negative in all 45 controls. Rif resistance was detected in 14 cases by GXpert and in 13 cases by MPCR. Rif resistance was confirmed in 13 cases with rpoB gene sequencing. There was one case of false Rif resistance detected by GXpert which was Rif susceptible on rpoB gene sequencing. Cost of doing MPCR was less than USD1 whereas GXpert required USD10 per isolate.

Conclusion

MPCR has a higher sensitivity than GXpert for diagnosing TBM. MPCR is a robust and cost effective method for diagnosis of TBM in low-resource and high-endemic countries.

Le texte complet de cet article est disponible en PDF.

Keywords : Molecular detection tuberculous meningitis, Rifampicin resistance, IS6110, MPB64, Multiplex PCR


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Vol 113

P. 38-42 - décembre 2018 Retour au numéro
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