Les analyses à haut débit appliquées à l’adénocarcinome pancréatique ont permis de décrire plusieurs sous-types moléculaires ayant pour la plupart des implications pronostiques fortes. Il n’y a, à ce jour, pas de classification intégrative multi-omics consensuelle comme dans les cancers du sein ou du côlon. Les classifications génomiques ont identifié un sous-type présentant une déficience dans la réparation de l’ADN (15 % des patients) rendant ces tumeurs très sensibles aux chimiothérapies à base de platine et possiblement aux inhibiteurs de PARP et aux immunothérapies. Les classifications transcriptomiques sont encore très débattues mais ont identifié un sous-type très agressif définissant un groupe de patient rechutant précocement potentiellement mauvais candidats à la chirurgie. Enfin, les approches basées sur la métabolomique ou la protéomique ont identifié des sous-types présentant une sensibilité particulière à certains composés ciblant les voies-clés de chaque sous-groupe. Ces classifications ne concernent que les cellules tumorales mais le micro-environnement est également hétérogène et il existe aussi probablement plusieurs types de stroma. La détermination des sous-types en pratique courante reste un challenge majeur car la majorité des technologies ayant permis de définir ces sous-types sont coûteuses, complexes et non adaptés aux prélèvements de routine qui sont pour la majorité des biopsies fixées en formol et incluses en paraffine au sein desquelles les cellules tumorales sont fortement contaminées par les cellules du micro-environnement et du caillot.

Multi-omics high throughput analyses lead to the description of multiple molecular subtypes of pancreatic adenocarcinoma with major prognostic impact for most of them. There is no consensual multilevel integrative classification yet like in colon or breast cancers. Genomic classifications have identified a tumor subtype (15% of the patients) with deficient homologous DNA repair-system leading to increase sensitivity to platinum-based therapies and possibly to PARP inhibitors and immunotherapies. Transcriptomic classifications are still debated but all have identified an aggressive subtype with a very poor prognosis, presumably unfit for a surgical approach. Finally, approaches based on metabolomic or proteomic profiling have identified subtypes with a particular sensitivity to compounds targeting the hallmarks metabolomics or oncogenic pathways of each subtype. These classifications were mostly based on tumor cell but the micro-environment is also very heterogeneous and several types of stroma will be described soon. Subtype determination in daily practice remains a major challenge as most technologies used to build these classifications are very expensive, requires dedicated bio-informatics analysis pipelines and are not adapted to routine samples that are mostly formal in fixed paraffin embedded biopsies, in which tumor cells are highly contaminated by the cell from the microenvironment and the clot.