Construire un format de données de polysomnographies (PSG) interopérable, libre et gratuit, conforme aux standards techniques actuels pour lire et analyser des big data de sommeil plus rapidement et plus simplement que le standard European Data Format (EDF).

Dans le cadre du projet Morpheo, d’analyse des tracés de sommeil par intelligence artificielle, il est indispensable de disposer d’un format de stockage commun. S’appuyant sur les formats de données médicales et biologiques existants, plusieurs formats ont été itérativement définis et testés par le groupe de travail à partir de l’analyse de 5148 PSG, à chaque fois lues et analysées sous les différents formats pour mesurer et comparer les performances. Un banc d’essai sur ces enregistrements a permis de comparativement quantifier les performances en lecture et écriture face au format EDF.

Le Morpheo Data Format (MDF) couvre les fonctionnalités des formats EDF et EDF+ tout en offrant plus de flexibilité et une plus grande rapidité de lecture et d’analyse. Chaque enregistrement de sommeil est ainsi stocké dans une arborescence de fichiers simple, dossier et sous-dossiers. Le MDF définit les modalités de stockage des signaux, annotations et métadonnées qui composent les PSG.

Le MDF a d’ores et déjà permis à des ingénieurs, médecins et techniciens du sommeil d’afficher et d’analyser des polysomnographies, aussi bien à travers des interfaces graphiques dédiées que grâce à des langage de programmation. La définition du format est disponible sur le lien : mdfspecs.md.