Les levures du genre Malassezia sont des levures d’actualité ayant connu, dans cette dernière décennie, une évolution taxonomique importante et un intérêt accru en pathologie humaine et animale. L’identification de ces levures peut se faire par les techniques phénotypiques, biochimiques et physiologiques qui restent laborieuses et parfois imprécises vu que certaines espèces présentent des caractéristiques très proches. Nous avons mis au point une PCR multiplex en temps réel avec des sondes spécifiques pour détecter les six espèces de Malassezia : M. globosa, M. furfur, M. restricta, M. sympodialis, M. slooffiae et M. pachydermatis. Notre étude prospective a été réalisée sur 120 échantillons collectés à partir de 60 animaux domestiques (23 chèvres, 10 chiens, 15 vaches, 3 chats, 8 lapins et 1 âne) et de 70 échantillons humains (28 patients atteints de pityriasis versicolor, 17 éleveurs et 25 personnes représentant un groupe témoin).

Quinze M. pachydermatis ont été identifiés chez les animaux. Nous avons identifié 61 isolats à partir des prélèvements humains : M. globosa (28), M. furfur (15), M. restricta (6), M. sympodialis (8), M. slooffiae (2) et M. pachydermatis (2). La PCR en temps réel nous a permis aussi de détecter huit cas de co-infection chez 6 patients et 2 éleveurs.

L’amplification a été spécifique pour chacune des espèces de Malassezia : M. globosa, M. pachydermatis, M. sympodialis, M. furfur, M. slooffiae et M. restricta. En outre, aucun signal positif n’a été retrouvé par la PCR en temps réel pour les souches n’appartenant pas au genre Malassezia. Nos résultats montrent que l’analyse était très efficace pour identifier les espèces de Malassezia. L’application de PCR multiplex en temps réel fournit un système d’identification sensible et rapide pour les espèces de Malassezia, qui peut être appliqué dans les enquêtes épidémiologiques et la pratique courante.