La ductopénie est une cause rare de cholestase prolongée, dont les étiologies sont multiples et correspondent à des maladies des petites voies biliaires intrahépatiques, sauf dans les cas de cholangites sclérosantes primitives et secondaires qui peuvent atteindre les voies biliaires extrahépatiques. Le diagnostic est histologique. Il montre une disparition des canaux biliaires intrahépatiques interlobulaires et septaux dans au moins 50 % des espaces portes, sur une biopsie hépatique qui doit en contenir au moins 10. La ductopénie atteint plus fréquemment l'adulte chez qui les cholangiopathies auto-immunes, en particulier la cholangite biliaire primitive, prédominent largement, alors que l'enfant est plutôt atteint dans le cadre de paucités biliaires syndromiques ou non syndromiques. La ductopénie d'origine médicamenteuse doit aussi être envisagée, chez l'adulte comme chez l'enfant. Enfin, certaines ductopénies se développent dans un contexte de transplantation, de chirurgie ou de lymphome. Les signes cliniques et biologiques en rapport avec la cholestase sont communs à toutes les étiologies. Le bilan étiologique comprend un interrogatoire poussé dont une enquête médicamenteuse, un bilan viral et auto-immun exhaustif et une imagerie non invasive des voies biliaires intra- et extrahépatiques. La ductopénie est dite « idiopathique » lorsque ce bilan est négatif. Le pronostic de la ductopénie est souvent péjoratif, lié au risque d'évolution vers la cirrhose biliaire. Cette mise au point anatomoclinique propose une actualisation des étiologies des maladies cholestatiques ductopéniantes d'origine immunologique, toxique, vasculaire, infectieuse ou néoplasique, incluant la cholangite à immunoglobulines G4 (IgG4), entité récente, et une liste de médicaments responsables de ductopénie histologiquement prouvée.