L'examen clinique est le point de départ de tout traitement d'orthopédie dentofaciale. Il va permettre la récolte des signes cliniques, des symptômes, qui vont servir de base à l'établissement d'un diagnostic, positif, étiologique et différentiel, et donc d'un plan de traitement. L'examen clinique est essentiel et doit donc être le plus complet et le plus précis possible. Il s'agit pour le praticien d'établir une véritable « cartographie » de son patient. Il obéit à des règles précises, dont aucune ne doit être négligée. L'examen clinique doit être conduit de manière standardisée et reproductible et se déroule habituellement en quatre phases : l'anamnèse, qui va permettre la récolte du motif de consultation, des attentes du patient, de son passé médical et dentaire ; l'examen exobuccal, qui permet de réaliser une évaluation esthétique, fonctionnelle, musculaire et articulaire du patient. Il est en général réalisé de face, puis de profil, de manière statique puis dynamique ; l'examen endobuccal, qui est réalisé arcades séparées puis en occlusion, de manière statique puis dynamique afin d'objectiver les malocclusions présentes ; et, enfin, l'examen fonctionnel, durant lequel l'orthodontiste va rechercher d'éventuelles dysfonctions ou parafonctions. L'examen clinique doit ensuite être rapproché des données recueillies par les examens complémentaires (moulages, radiographies, céphalométrie, etc.) afin d'ajuster au mieux le diagnostic et le plan de traitement qui en découlent.