Définir l’apport de la microbiologie dans la prise en charge diagnostique des abcès de cornée avec critères de gravité.

Étude rétrospective monocentrique au CHU de Reims entre janvier 2012 et décembre 2014 portant sur les résultats des cultures bactériennes et fungiques, ainsi que des PCR virales (VZV, CMV, EBV, HSV1&2, adénovirus) et amibiennes réalisées sur des patients hospitalisés pour abcès de cornée. Si disponibles, les boîtiers de lentilles étaient analysés.

Cent six patients ont été hospitalisés pour un abcès de cornée, dont 30 étaient porteurs de lentilles (28,3 %). Soixante-quatre cultures bactériennes étaient positives (68 %). Vingt-cinq espèces bactériennes différentes ont été identifiées avec une majorité de bactéries gram positives (67,92 %). Chez les porteurs de lentilles, l’AV initiale était meilleure que chez les non porteurs de lentilles (p=0,0004) et 37 % des bactéries identifiées, la majorité, étaient des gram positives. Sur 11 boîtiers analysés, dans un seul cas (3,3 %), le résultat était corrélé à celui effectué sur la cornée. Seuls 9 prélèvements sur les 323 extractions d’ADN virales et PCR en temps réel étaient positifs (2,8 %), dont 7 à HSV1. Aucun traitement antiviral n’avait été préalablement instauré. L’analyse mycologique diagnostiquait 2 infections sur les 97 prélèvements réalisés et une colonisation des boîtiers était détectée dans 63,6 % des cas (7/11 boîtiers). Une seule des 40 PCR Acanthamoeba sp. était positive.

La réalisation systématique d‘examens microbiologiques est une bonne démarche diagnostique face au polymorphisme des présentations cliniques des abcès, dont la clinique peut parfois se montrer extrêmement trompeuse. L’analyse du boîtier semble peu contributive dans la démarche diagnostique des kératites infectieuses. L’incidence élevée du staphylocoque dans les kératites bactériennes, et la prédominance des infections par bactéries gram positives chez les porteurs de lentilles sont ici remarquées.

To investigate the contribution of microbial analysis in the diagnosis and management of severe microbial keratitis.

This is a monocentric retrospective study at the University Hospital of Reims from January 2012 to December 2014. Corneal scrapings with infectious keratitis were subjected to routine bacterial and fungal culture. PCR was also performed to detect various viral DNA (VZV, CMV, EBV, HSV 1 & 2, adenovirus) and Acanthamoeba sp. DNA. All contact lens cases were analyzed if available.

One hundred and six patients were hospitalized, including 30 contact lens wearers (28.3%). Sixty-four bacterial cultures were positive (68%). Twenty-five different bacterial species were identified with a majority of gram-positive bacteria (67.92%). Among contact lens wearers, the initial VA was better than non-wearers (P=0.0004) and 37% of bacteria identified (a plurality) were gram positive. Of 11 contact lens case analyzed, in only one case (3.3%) did the result correlate with the corneal culture. Only 9 samples from the 323 viral DNA extractions and real time PCR were positive (2.8%); 7 were HSV1. No prior antiviral therapy had been started. Fungal culture was positive in 2 of the 97 corneal samples taken and 63.6% of the contact lens cases (7/11 cases). Only one of the 40 Acanthamoeba sp. PCR's was positive.

The systematic performance of microbiological investigations is a good diagnostic approach given the polymorphism of clinical presentations of corneal ulcers, which can sometimes be extremely misleading. Culture of contact lens cases appears ineffective for the detection and determination of the causative microorganism. The high incidence of Staphylococcus in bacterial keratitis and the prevalence of infections with gram-positive bacteria in contact lens wearers were noted.