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Antifungal activity of a Saharan strain of Actinomadura sp. ACD1 against toxigenic fungi and other pathogenic microorganisms - 01/09/16

Doi : 10.1016/j.mycmed.2016.02.017 
A. Lahoum a, A. Aouiche a, N. Bouras a, b, C. Verheecke c, H.-P. Klenk d, N. Sabaou a, , F. Mathieu c
a Laboratoire de Biologie des Systèmes Microbiens (LBSM), École Normale Supérieure de Kouba, Alger, Algeria 
b Département de Biologie, Faculté des Sciences de la Nature et de la Vie et Sciences de la Terre, Université de Ghardaïa, BP 455, 47000 Ghardaïa, Algeria 
c Laboratoire de Génie Chimique, LGC, Université de Toulouse, UMR 5503 (CNRS/INPT/UPS), Toulouse, France 
d School of Biology, Newcastle University, Ridley Building, Newcastle upon Tyne, NE1 7RU, United Kingdom 

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Summary

A new strain of actinobacteria, designated ACD1, was isolated from a Saharan soil sample in the Hoggar region (Algeria). Morphological study led to this strain being classified as a member of the Actinomadura genus. Phylogenetic analysis based on the 16S rRNA gene showed that the strain is closely related to Actinomadura sediminis DSM 45500T (98.5% sequence similarity). Furthermore, strain ACD1 presented a strong activity against mycotoxigenic and phytopathogenic fungi, including Aspergillus and Fusarium strains, and other pathogenic microorganisms. The kinetics of antimicrobial activity were investigated on ISP-2, Bennett and TSB media. Four solvents (n-hexane, dichloromethane, ethyl acetate and n-butanol) were used for the extraction of the produced antibiotic. The highest antimicrobial activity was obtained using the butanolic extract from the ISP-2 medium after seven days of fermentation culture. The active antibiotic was purified by reverse-phase HPLC using a C18 column. The UV-visible and mass spectra were determined. The minimum inhibitory concentrations (MIC) of this antibiotic were determined against pathogenic microorganisms.

Le texte complet de cet article est disponible en PDF.

Résumé

Une nouvelle souche d’actinobactérie, désignée ACD1, a été isolée à partir d’un échantillon de sol provenant de la région du Hoggar (Algérie). L’étude morphologique de cette souche a permis de la rapprocher du genre Actinomadura. L’analyse phylogénétique basée sur le gène codant pour l’ARNr 16S a montré que la souche-type la plus proche phylogénétiquement est Actinomadura sediminis DSM 45500T (98,5 % de similarité). De plus, la souche ACD1 a présenté une forte activité contre des champignons phytopathogènes et mycotoxinogènes, y compris les souches des genres Aspergillus et Fusarium et d’autres microorganismes pathogènes. Les cinétiques de l’activité antimicrobienne sont réalisées sur les milieux ISP-2, Bennett et TSB. Quatre solvants (le n-hexane, le dichlorométhane, l’acétate d’éthyle et le n-butanol) ont été utilisés pour l’extraction de l’antibiotique produit. La meilleure activité antimicrobienne a été obtenue en utilisant l’extrait butanolique du milieu ISP-2 après sept jours de fermentation. L’antibiotique actif est purifié par HPLC en utilisant une colonne C18. Le spectre UV-visible et le spectre de masse sont déterminés. Les concentrations minimales inhibitrices (CMI) sont réalisées contre des microorganismes pathogènes.

Le texte complet de cet article est disponible en PDF.

Keywords : Actinobacterium, Actinomadura, Pathogenic microorganisms, Antimicrobial activity

Mots clés : Actinobactérie, Actinomadura, Microorganismes pathogènes, Activité antimicrobienne


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Vol 26 - N° 3

P. 193-200 - septembre 2016 Retour au numéro
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