Our understanding of the systematics of the Eurytemora affinis complex developed at a fast pace over the last decades. Formerly considered as a complex of cryptic species, it is now believed to include three valid species: E. affinis, Eurytemora carolleeae, and Eurytemora caspica. American and European representatives have been studied in detail with respect to fine-scale geographic distribution, levels of genetic subdivision, evolutionary and demographic histories. Morphological components have been less explored. In this study, an analysis of the phylogeny and morphology of E. affinis was done, with a special focus on European populations. A total of 447 individuals of E. affinis from Europe were analyzed with genetic tools and 170 individuals according to morphological criteria. Common and new morphological and genetic features were analyzed. For this, we used ML and Bayesian methods to analyze the bar coding mt-DNA gene cytochrome c oxidase I subunit. Both genetic and morphological analyses showed high heterogeneities among the E. affinis populations from Europe. As a result, three local populations of E. affinis in Western Europe, including the European part of Russia, were established. Their genetic and morphological heterogeneity corresponded to the subspecies level.

Notre compréhension de la systématique au sein de l’espèce complexe Eurytemora affinis s’est développée considérablement au cours des dernières décennies. Trois différentes espèces valides sont désormais décrites au sein de ce groupe, autrefois considéré comme un complexe d’espèces cryptiques : E. affinis, Eurytemora carolleeae et Eurytemora caspica. Les populations américaines et européennes de ce copépode ont été étudiées en détail, ce qui a permis une bonne description de leur distribution à une échelle géographique fine, des niveaux de subdivision génétique, de leurs traits de vie et de leurs stratégies évolutives. Les traits morphologiques ont été moins explorés. Dans cette étude, une analyse mise à jour de la phylogénie d’E. affinis et de sa morphologie a été réalisée, avec un zoom particulier sur la morphologie des populations européennes. Un total de 447 individus d’E. affinis de l’Europe ont été analysés avec des outils génétiques ; 170 individus l’ont été selon des critères morphologiques. Des caractéristiques morphologiques et génétiques communes et nouvelles ont été analysées. Pour ceci, nous avons utilisé des méthodes bayésiennes pour analyser les séquences d’ADN du gène du génome mitochondrial codant pour la première sous-unité du cytochrome oxydase (COI). Des analyses tant génétiques que morphologiques ont mis en évidence de fortes hétérogénéités congruentes parmi les populations européennes d’E. affinis. En conséquence, trois populations locales d’E. affinis d’Europe occidentale, y compris la partie européenne de la Russie, ont été établies. Leur hétérogénéité génétique et morphologique correspond au niveau de la sous-espèce.