Une évolution épidémiologique Jusqu'au milieu des années 1980, les complications infectieuses (pneumonies, septicémies) observées chez les patients neutropéniques étaient dans 70 % des cas d'origine bactérienne avec des bacilles à Gram négatif (Escherichia coli, Klebsiella sp, Pseudomonas aeruginosa) isolés 8 fois sur 10. Parmi les bactéries à Gram positif, Staphylococcus aureus était très largement prédominant. Depuis, le profil étiologique des infections bactériennes a évolué avec prédominance (60 à 70 %) des bactéries à Gram positif (staphylocoques à coagulase négative, streptocoques viridans ) et modification de leur épidémiologie avec notamment moindre fréquence des infections à P. aeruginosa .

Les bactéries à Gram positif Les staphylocoques à coagulase négative sont parmi les premiers germes responsables de bactériémies nosocomiales (cathéters veineux centraux) et ils sont en général multirésistants. Les streptocoques viridans constituent une cause fréquente de bactériémie ; ils sont souvent sensibles aux antibiotiques actifs sur les bactéries à Gram positif, mais l'incidence des souches résistantes augmente. Les entérocoques sont fréquemment responsables de colonisation chez les patients neutropéniques, plus rarement d'infections ; ils posent essentiellement des problèmes de résistance aux antibiotiques, notamment aux glycopeptides. D'autres bactéries à Gram positif peuvent être responsables d'infections chez les patients neutropéniques ; ils doivent impérativement être identifiés car ils nécessitent une antibiothérapie appropriée.

Les bactéries à Gram négatif Parmi les entérobactéries, Escherichia coli est la plus fréquemment isolée, avec le problème de l'augmentation d'incidence de la résistance aux fluoroquinolones. Pseudomonas aeruginosa, plus rarement en cause qu'auparavant, reste associé à un taux de mortalité beaucoup plus élevé que celui noté pour les autres micro-organismes. D'autres bactéries à Gram négatif peuvent être identifiées ; elles nécessitent une antibiothérapie adaptée car elles sont souvent naturellement multirésistantes aux antibiotiques.

Rôle du laboratoire Pour le diagnostic des infections chez le patient neutropénique, le laboratoire de microbiologie joue un rôle déterminant. Il assure l'analyse d'examens biologiques divers : hémocultures, méthodes permettant le diagnostic d'infection sur cathéter laissé en place, coprocultures (recherche de bactéries entéropathogènes habituelles, quantification en cas de décontamination digestive, dépistage de bactéries multirésistantes), examen cytobactériologique des urines, prélèvements d'origine respiratoire, examen cytobactériologique du liquide céphalorachidien.

Epidemiological evolution Until the mid-eighties, infectious complications (pneumonia, septicemia) observed in neutropenic patients were, in 70% of cases, of bacterial origin with Gram negative bacillae ( Escherichia coli, Klebsiella sp, Pseudomonas aeruginosa ) isolated 8 times out of 10. Among the Gram positive bacteria, Staphylococcus aureus predominated. The etiological profile of bacterial infections has since evolved with a predominance (60 to 70%) of Gram positive bacteria (coagulase-negative staphylococci, viridans streptococci) and a change in the epidemiology of the Gram positive bacteria notably with a lesser frequency of P. aeruginosa infections.

The Gram positive bacteria Coagulase-negative staphylococci are among the first germs responsible for nosocomial bacteremia (central venous catheters) and they are usually multiresistant. Viridans streptococci are a frequent cause of bacteremia; they are generally sensitive to antibiotics active on Gram positive bacteria, but the incidence of resistant strains is increasing. Enterococci are in majority responsible for colonisation in neutropenic patients and less frequently for infections; they raise the problem of resistance to antibiotics, notably to glycopeptides. Other Gram positive bacteria can be responsible for infections in neutropenic patients; it is crucial that they be identified because they require treatment with an appropriate antibiotic.

Gram negative bacteria Among the enterobacteria, Escherichia coli is predominantly isolated and raises the problem of the increasing incidence of resistance to fluoroquinolone. Pseudomonas aeruginosa , less frequently responsible today, remains associated with a far greater rate of mortality than that observed with the other microorganisms. Other Gram negative bacteria can be identified; they require an adapted antibiotherapy because they are often naturally multiresistant to antibiotics.

The role of the laboratory For the diagnosis of infections in neutropenic patients, the microbiology laboratory has a determinating role. The laboratory ensures the analysis of various biological examinations: blood cultures, methods permitting the diagnosis of an infection on a permanent catheter, copro-cultures (research for common enetropathogens, quantification in the case of digestive decontamination, screening for multiresistant bacteria), cytobacteriological examination of urine, samples of respiratory origin, cytobacteriological examination of cerebro-spinal fluid…).