Physiopathologie des aneuploïdies : conséquences du déséquilibre chromosomique sur l’organisation nucléaire et l’expression globale du génome - 20/11/15
, Aurélie Coussement b, Thomas Guilbert c, Florent Dumont d, Sébastien Jacques d, Laurence Cuisset e, Mathieu Chicard d, Pierre Bourdoncle c, Franck Letourneur d, Agnès Choiset b, Jean-Michel Dupont bRésumé |
Objet |
Dans le noyau interphasique, la chromatine est organisée en territoires chromosomiques (TC) [1]. Le lien entre cette organisation et la régulation de l’expression du génome reste méconnu. Afin de préciser cette organisation, nous avons étudié un modèle de désorganisation : les aneuploïdies en supposant que la présence d’un chromosome surnuméraire pouvait entraîner une perturbation de la distribution des TC, elle-même conduisant à une modification de l’activité transcriptionnelle.
Méthodes |
Étude de la position des TC 18 et 21 par FISH 3D dans les noyaux interphasiques de fœtus aneuploïdes et témoins. Comparaison des volumes des noyaux et des TC. Parallèlement, une analyse transcriptomique comparative pangénomique des cellules a été réalisée afin d’objectiver des dérégulations d’expression.
Résultats |
Nous n’avons pas observé de différence de positions des TC 18 et 21 entre les fœtus atteints et les témoins. Si les volumes nucléaires n’étaient pas modifiés, ceux des TC l’étaient. Nous avons mis en évidence des modifications d’expression d’une partie des gènes portés par les chromosomes d’intérêt ; mais également de gènes sur les autres chromosomes.
Discussion |
En cas d’aneuploïdie, l’organisation des TC aneuploïdes dans le noyau semble globalement respectée. Il existerait cependant une diminution du volume de ces TC sans modification du volume des noyaux, interrogeant au détriment de quel compartiment, se fait cette compaction. L’analyse transcriptomique renforce l’idée d’une combinaison d’un effet de dosage génique et d’une rupture de l’homéostasie : aux gènes dérégulés portés par les chromosomes trisomiques, s’ajoutent des modifications d’expression du reste du génome. Ces dérégulations concernent de multiples voies impliquées dans le développement mais aussi des gènes au potentiel rôle dans l’apparition de traits phénotypiques.
Conclusion |
Il semblerait exister un lien entre le déséquilibre génique des chromosomes aneuploïdes et les dérégulations de l’ensemble du génome. La participation de la réorganisation des TC reste à affiner.
Le texte complet de cet article est disponible en PDF.Mots clés : FISH 3D, Aneuploïdie, Territoire chromosomique, Noyau interphasique, Analyse transcriptomique
Plan
Vol 99 - N° 327
P. 163 - décembre 2015 Retour au numéro
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