Le séquençage par NGS est parfaitement adapté au diagnostic des HHC/KS en permettant une analyse systématique des gènes identifiés dans les formes isolées ou même combinés à d’autres déficiences endocriniennes. L’objectif était d’étudier la prévalence de l’oligogénisme, c’est-à-dire la responsabilité dans le phénotype HHC/KS de la coexistence de plusieurs mutations localisées sur des gènes différents.

Nous avons sélectionné et analysé 100 patients HHC/KS grâce à une « puce NGS » comprenant un panel de 70 gènes (codant±50bp) en utilisant un séquenceur Illumina MiSeq. L’analyse de 35 gènes « diagnostics » (parmi eux : GNRHR, KISS1R, TACR3, KAL1, FGFR1,CHD7…) est complétée par celle de 35 gènes « candidats » sélectionnés sur des modèles animaux ou sur leur fonction biologique. L’analyse bioinformatique est réalisée sur notre propre portail intranet Galaxy en suivant les recommandations du BroadInstitute. L’approche NGS, nous assure une couverture de 98 % des régions d’intérêt avec une profondeur de lecture>30X.

Elle a permis d’identifier des mutations ponctuelles (101 sur 27 gènes) ou des grands réarrangements chez ces 100 patients HHC/KS. Cette approche systématique nous a permis l’identification des causes génétiques d’HHC de façon beaucoup plus rapide et efficace. Elle a fait découvrir chez plus de 50 % des patients des potentiels oligogénismes, à la fois sur gènes « diagnostics » ou candidats, non décrits dans la database EXAC.

Cette étude par NGS révèle l’importance de l’oligogénismes dans les HHC. Des analyses familiales abouties, associées à la caractérisation fonctionnelle des variants, sont indispensables pour établir formellement l’étiologie moléculaire des HHC/KS.