Les infections broncho-pulmonaires au cours de la mucoviscidose sont principalement liées à Pseudomonas aeruginosa et Staphylococcus aureus . En France, la colonisation bronchique par S. aureus atteint plus de la moitié des patients, liée à l'adhérence de S. aureus au mucus et au défaut de la clairance muco-ciliaire. L'examen bactériologique permet de déterminer si S. aureus est présent à plus de 10 ⁵ UFC/ml dans l'expectoration et de rechercher des variants nains, à croissance lente et résistants au cotrimoxazole. L'acquisition de S. aureus est précoce et fréquente du fait de la réceptivité des patients ; le portage nasal est plus fréquent que chez les sujets sains et peut constituer une source de contamination endogène. Pour la plupart des malades, la même souche est retrouvée pendant plusieurs mois. Certains clones de S.aureus sont retrouvés chez de nombreux patients et les membres de leurs familles, suggérant une transmission croisée fréquente, néanmoins pas plus fréquente entre patients, par conséquent ne nécessitant pas de mesure de séparation. La colonisation par des souches résistant à la méticilline (environ 20 %) ne semble pas corrélée avec une détérioration de la fonction respiratoire. Les antibiotiques les plus souvent actifs sont les glycopeptides, la pristinamycine et le co-trimoxazole. Pour l'érythromycine, l'acide fusidique et la rifampicine il faut noter 15 % d'isolats résistants de plus chez les patients par rapport aux enfants sains. Si les cures continues d'antibiotiques font baisser les cultures positives de S. aureus , il y aurait parallèlement plus d'isolements de P. aeruginosa , surtout chez les jeunes enfants, et les effets bénéfiques sur la fonction respiratoire ne sont pas constamment observés.

Pulmonary infections in patients with cystic fibrosis (CF patients) involve generally Pseudomonasaeruginosa and Staphylococcus aureus . In France, bronchial colonisation by S. aureus is found in more than 50 % of patients and its adherence to the bronchial mucus is associated with an abnormal muco-ciliary clearance. Bacteriology examination permits the evaluation of the S. aureus inoculum and it significance if it is higher than 10 ⁵ CFU/ml in the sputum. The test permits as well to look for small colony variants, slow growing and resistant to co-trimoxazole. The acquisition of S. aureus occurs early in these susceptible patients. Nasal carriage is more frequent in CF patients than in healthy subjects, and it might be the source of endogenous contamination. In a given patient the same clone can be found for several months and some specific clones are found in many patients and in healthy members of their family. About 20 % of strains are meticillin-resistant (MRSA) but this does not correlate with deterioration of respiratory functions. The most active antibiotics to be used in the control of S. aureus infection are glycopeptides, pristinamycin and co-trimoxazole. With erythromycin, fusidic acid, rifampicin, there are 15 % more resistant strains in CF patients compared to healthy children. Continuous administration of antibiotics may result in decrease of cultures positive with S. aureus but increasing isolation of Pseudomonas aeruginosa is seen in young children. The treatments do not result constantly in improvement of respiratory function.